illumina测序为什么要消化第二链

狮子只想被爱2022-10-04 11:39:542条回答

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asi197977 共回答了22个问题 | 采纳率86.4%: illumina测序现主要是两端测序,其测序策略为测DNA一条链的前100bp,然后再测两一条链的另一端的100bp,所以在illumina测时候是一条链一条链的测序的.这也是为什么后面要消化掉第二条链的原因.; 1年前

开心孤行侠共回答了2个问题 | 采纳率: 只有单链的情况下，才能碱基互补配对，进行扩增延伸。
据我所知，到目前为止，所有的测序仪都是单链测序的。; 1年前

在核苷酸测序（illumina测序等）中有mate pair和pair end这两个有什么区别啊?只听说mate pai 在核苷酸测序（illumina测序等）中有mate pair和pair end这两个有什么区别啊?只听说mate pair是环化的 mate pair是怎么环化的?测序后的序列中mate pair是什么样的?pair end是什么样子的? 西瓜厉害1001年前1: anniechu 共回答了16个问题 | 采纳率100%

你已经解释的很清楚了,mate pair测序的DNA文库是将很长的DNA进行环化,环化的接口处连接识别序列,然后打断,富集含有识别序列的DNA,再进行双向测序,那么双向测序的插入片段长度就会很长.
而pair end是直接在DNA两端假设接头进行双向测序,插入片段长度较短

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为什么pacbio的测序技术比illumina的测序技术在测同等长度的核酸序列时耗时要 loglgo1年前1: Quitty_777 共回答了22个问题 | 采纳率86.4%

前者技术复杂

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第二代基因测序技术的流程分别是什么,四种,Roche 454测序技术,Illumina Solexa测序技术,ABI S 第二代基因测序技术的流程分别是什么,四种,Roche 454测序技术,Illumina Solexa测序技术,ABI SOLiD测序 lxf0002141年前3: mynamejiajia 共回答了17个问题 | 采纳率88.2%

454测序：DNA文库制备→emPCR→上机测序
Solexa测序：文库制备→Cluster扩增→边合成边测序
SOLiD测序：样品制备→Emulsion PCR和底物准备→测序反应→图像收集→数据分析

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关于illumina测序,basespace是什么意思 base这里是碱基的意思么?懂生物信息学和高通量测序的帮帮忙 关于illumina测序,basespace是什么意思 base这里是碱基的意思么?懂生物信息学和高通量测序的帮帮忙 关于illumina测序,basespace是什么意思base这里是碱基的意思么?懂生物信息学和高通量测序的帮帮忙谢谢了... 东快uu达人1年前1: cjkg 共回答了22个问题 | 采纳率81.8%

BaseSpace is Illumina’s genomics cloud computing environment for next-generation sequencing (NGS) data analysis.Now biologists and informaticians can easily and securely analyze,archive,and share sequencing data.NGS data analysis is simplified and accelerated with push-button tools.Cumbersome and time-consuming data transfer steps are eliminated.Productivity is improved.摘自illumina官网.
BaseSpace就是云计算环境了.具体你去官网查查吧!竟然在百度问这么专业的问题,厉害!

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关于基因测序技术Illumina Genome Analyzer测序工作原理：边合成边测序.即生成新DNA互补链时,要么 关于基因测序技术 Illumina Genome Analyzer测序工作原理：边合成边测序.即生成新DNA互补链时,要么加入dNTP通过酶促级联反应催化底物激发出荧光,要么直接加入被荧光标记的dNTP或半简并引物,在合成或连接生成互补链时,释放出荧光信号.通过捕获光信号并转化为一个测序峰值,获得互补链序列信息. 上面那段话中最后那句是什么意思? 是不是测序峰值的高低代表不同dNTP发出的荧光信号? aokyb1年前1: 我知我傻的可以共回答了13个问题 | 采纳率100%

上面这段话是普通二代测序（454测序法）的原理,不同的荧光信号表示不同的碱基.
你说的没错,测序结果返还给客户的时候一般都有两个文件,一个是Seq,一个是ab1,其中ab1这个文件就是测序峰图,测序结果就是根据峰图确定的.你也可以自己尝试检查这个峰图,来确定有些检测是不是测出来了,但是转换错了.
有问题我们可以继续交流.

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Illumina_HiSeq_2000高通量测序结果分析 Illumina_HiSeq_2000高通量测序结果分析 你好,最近在看TCGA数据库,其中raw_count,scaled_estimate,normalized_count,没能看明白什么意思,分别代表什么,我想做转录水平基因表达差异分析,需要用到哪些数据. laaa1231年前2: magical 共回答了22个问题 | 采纳率86.4%

aw_count应该是某个转录本/基因的测到的原始reads条数,normalized_count是经过标准化的数据量；
差异分析需要统计 raw_count,FPKM值,pvalue

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