简并引物特异引物还有16s的引物有什么不同用它们PCR出来的产物看条带能看出来吗

wq05512022-10-04 11:39:541条回答

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阮建邦共回答了20个问题 | 采纳率95%: 1、简并引物：序列未完全清楚的核酸的一种引物设计方案,比如TGGC(x)AAT,则设计引物时（X）位置可分别用ATCG四条引物
特异引物：这个不用说吧,就是序列清楚后自己根据上下要设计的普通引物
16s的引物：常被用于鉴定,一般引物可在文献、网站上找到.16S rRNA所对应的 16S rDNA基因在细菌基因组中具有高度保守性；对于同一种细菌其16S rDNA基因组的同源性应大于70 %.对16S rDNA而言,如果出现3个碱基以上的差异就可以断定细菌不属于同一种属；
2、PCR出来的产物看条带比较的是大小,16S rDNA挺多用的是150bp左右的,但简并引物和特异引物则看具体情况了,如果设计的引物区间差异大,是可以分开的; 1年前

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到Genbank上去比对,找相识基因,最好是找同一生物种的,还可以翻译出来,比对蛋白质序列,分析可能具有的功能,下一步能做的方向很多,建议找篇研究某个基因的毕业论文来看,上面会有详尽的方法,多看文献,自然就有研究思路了

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我也遇到过类似的问题,根据同源性设的引物来PCR,结果出来的是非特异条带,要不就是没有.
还是得优化条件比如引物和模板的比例

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中文名称：
简并引物
英文名称：
degenerate primer
定义：
获得序列未完全清楚的核酸的一种引物设计方案,特点是所设计的引物序列某位置的核苷酸可以分别是两个或两个以上不同的碱基,结果所合成的引物是该位置上不同序列的混合物.
应用学科：
生物化学与分子生物学（一级学科）；方法与技术（二级学科）

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你用直接提取的dna做模板pcr出来的是他的基因组序列包括了内含子的但是用总RNA反转录出来的cdna pcr出来的只有外显子是经过了转录后剪切的
主要是看你要用来干什么如果是要过表达最好是用总RNA 反转出来的cdna做模板

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简并引物中的简并度是什么意思 爱不给爱1年前1: 海边椰树_Jane 共回答了13个问题 | 采纳率84.6%

就是简并碱基的乘积比如aaggtt（a/c/g）tt（t/a）ggt（g/c）括号里面的是简并碱基乘积是3*2*2=12简并度就是12呗呵呵 ok?

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