RNA是顺式作用元件吗顺式作用元件：是指那些与结构基因表达调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别和结合的特异DNA序列.

上有启动子元件是针对位置而言的；
顺式作用元件是针对其作用而言的.

顺式作用元件直接用ChIp on Chip来做,简单的很所谓顺式作用因子,是指必须和目的基因位于同一DNA分子上才能发挥调控作用的的原件,因此通常他们是指一些核酸序列（启动子,增强子,miRNA的作用靶序列等等）,而反式作用因子的定义这是当它和被调节基因不位于同一DNA分子上时也能发挥调控作用（当然,在同一DNA分子上时也能发挥作用）,它们通常是DNA编码的蛋白或者核酸（转录因子,miRNA等等）.
假如我没记错的话,反式作用和顺式作用的定义最开始是在原核生物中建立起来的,可能是研究乳糖操纵子时引入的概率（不确定）,而原核生物是没有组蛋白的,因此chip-on-chip似乎不是研究顺势和反式作用的必需条件.
从定义上可以看出来,鉴定顺式和反正的作用首要的是要确定该元件发挥作用是否需要和目标基因在同一分子上.所有你首先该做的是把你怀疑的顺式或者反式作用原件克隆在同一个质粒（A组）上或者分别克隆在两个单独的质粒上(B组),假如是顺式作用的,仅在A中能看到调节作用,是反式作用的,在A和B中都能看到调节作用.在确定是顺式还是反式作用以后,在根据该元件的性质来研究所谓模式.

顺式作用元件存在于基因旁侧序列中,包括启动子,增强子等,它本身不编码任何产物,只是提供一个作用位点,要与反式作用因子结合才起作用.而反式作用因子就是参与基因表达调控的蛋白质因子,与顺式作用元件结合起作用,有两个功能结构域：DNA结合结构域和转录活化结构域.

不是所有的顺式作用元件都在结构基因前面,只要是和蛋白质有作用的DNA序列都叫做顺式作用元件.

外源基因在原核宿主内表达不能含有内含子,所以不能用基因组DNA,需要利用原核基因的强启动子和S-D序列（顺势作用原件）,导入后要形成正确的阅读框架,涉及到的顺势作用原件：启动子,S-D序列,终止子,衰减子等.
真核基因在原核基因内表达有四大困难：1,因为缺乏转录后加工机制,只能表达克隆的cDNA,不能表达真核基因组DNA.2,缺乏适当的翻译后加工机制,所表达的蛋白质不能形成适当的折叠或进行糖基化修饰.3,表达的蛋白常形成不溶性的包涵体,分离纯化时需要进行复杂的复性处理,方可得到有活性的蛋白质.4,很难表达大量的可溶性蛋白.

所谓顺式作用因子,是指必须和目的基因位于同一DNA分子上才能发挥调控作用的的原件,因此通常他们是指一些核酸序列（启动子,增强子,miRNA的作用靶序列等等）,而反式作用因子的定义这是当它和被调节基因不位于同一DNA分子上时也能发挥调控作用（当然,在同一DNA分子上时也能发挥作用）,它们通常是DNA编码的蛋白或者核酸（转录因子,miRNA等等）.
如果我没记错的话,反式作用和顺式作用的定义最开始是在原核生物中建立起来的,可能是研究乳糖操纵子时引入的概率（不确定）,而原核生物是没有组蛋白的,因此chip-on-chip似乎不是研究顺势和反式作用的必需条件.
从定义上可以看出来,鉴定顺式和反正的作用首要的是要确定该元件发挥作用是否需要和目标基因在同一分子上.所有你首先该做的是把你怀疑的顺式或者反式作用原件克隆在同一个质粒（A组）上或者分别克隆在两个单独的质粒上(B组),如果是顺式作用的,仅在A中能看到调节作用,是反式作用的,在A和B中都能看到调节作用.在确定是顺式还是反式作用以后,在根据该元件的性质来研究所谓模式.