引物二聚体是什么?我知道是怎么产生的,但是请附带图说明它是什么特点吧!

kiss汐2022-10-04 11:39:542条回答

引物二聚体是什么?我知道是怎么产生的,但是请附带图说明它是什么特点吧!
我是想麻烦附图---附一张电泳的图说明，如果是引物二聚体会呈现什么结果？如果判断有些电泳图上出现的是引物二聚体

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魔戒上的钻共回答了11个问题 | 采纳率90.9%: 图示,最下面一排带.其电泳特征就是在100bp 以下,条带模糊一片,甚至可能为多条带,带型无绝对规律可循.; 1年前

qdty 共回答了23个问题 | 采纳率: 什么叫什么特点？
是两个primer自己有部分能够互补，所以就能够互相结合，具体见图，在PCR的过程中会跟你想要的PCR产物竞争，而且一般效率都会很高，因为primer dimer的size很小
图片来自英文维基
图暂时手头没有，就是大概大小在20-30bp的一条band，经常跟真正的产物一样亮甚至更亮，比较容易区分的方法就是如果在你的水control里面就看到的话就很可能有primer dimer; 1年前

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其次,在PCR时提高退火温度可以提高PCR的特异性,可以减少引物二聚体.

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你要重新设计引物了有引物2具体有好几个峰,谁也不知道是哪个,是产物的话主要看溶解温度,溶解温度高一般是产物.建议重新设计引物,重做梯度PRC 电泳分析.

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首先检查模板有没问题,然后降低PCR退火温度试试,降低退火温度可增加引物的结合量,但也增加了错配可能.也可以换种PCR Mix.还不行的话换对引物二聚体少的引物.

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这个不好说：一般引物二聚体小于150BP.条带模糊、条带宽、跑的比较快在溴酚蓝前面.你可以跑胶过程总观察一下.如果不是可能为非特异性扩增.您片段要是比较短建议您克隆后测序效果比较好.

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1.确定DNA模板为阳性,即确定含有目标序列；
2.对退火温度设置温度梯度,琼脂糖电泳检测是否有目标条带,即使可能并不清晰；
3.选取最清晰的温度,在PCR体系中设置镁离子浓度梯度,选取最理想的条件.
如果是以前曾经成功扩增、现在条件一样却没法重复的,个人经验要特别注意下模板DNA的质量、尤其是PH值.另外由于不清楚您实验的细节、所用试剂和反应条件,如有误解还请见谅...

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影响不大.探针法没影响,染料掺入法,现在的仪器都自动刷掉那些长度太小的扩增信号.
有人说可能对溶解曲线产生影响,不过我做染料掺入法做的少,没试过.
当然在设计引物时避免引物形成自身二聚体或互相二聚体是最好的,实在是形成了也没关系,上机跑一次呗,一小时的事.

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