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GTF与GFF文件格式的区别与转换

2023-06-24 20:16:51
TAG: gff
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里论外几

GTF与GFF文件都是用于存储注释信息的文本类型,经常可以看到二者格式之间的相互转换。二者的名字相似,连内容都极为相似,那么二者的差异究竟在哪里呢?

GFF文件是一种用来描述基因组特征的文件,现在我们所使用的大部分都是第三版)(GFF3)。gff文件除gff1以外均由9列数据组成,前8列在gff的3个版本中信息都是相同的,只是名称不同。

第9列attributes的内容存在很大的版本特异性,9列信息(以gff3为例)分别是:

GFF允许使用#作为注释符号,例如很多GFF文件都会使用如下的两行来表明其版本其创建日期:

GFF文件每一列所代表的含义前面表格中有,但请注意,它的第3列 feature type 是不受约束的,你可以使用任意的名称,但也不要太淘气~用一些适当的名称对于后面的分析会有很大的帮助。

我们需要注意的是GFF文件的第9列,从第二版开始(GFF2),所有的属性都以 标签=值 的方式呈现,各个属性之间以 ; 作为分隔符

在最新版本的GFF文件中(GFF3),有一些是已经预先定义的属性特征,并且这些特征往往还有特殊的含义:ID这个标签实在各行都要有的;另外有一个Parent的属性,它指明type所从属的上一级ID。

当前所广泛使用的GTF格式为第二版(GTF2),它主要是用来描述基因的注释。GTF格式有两个硬性标准:

gtf2的内容和gff3也是很相似的,区别只在其中的3列:

使用Cufflinks里面的工具"gffread":

脚本运行

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女生说GFF是什么意思?

GFF有很多种可能的含义,这取决于具体的语境。在不同的场合下,GFF可能代表不同的意思。一般来说,如果你不知道上下文是什么,很难准确地猜测GFF的意思。建议你向女生进一步询问或者请她解释一下GFF是什么意思。
2023-06-24 17:57:383

台达变频器显示GFF是什么意思?

模块坏的可能性也有
2023-06-24 17:57:496

台达变频器显示GFF是什么意思?

属于接地故障,检查去电机的线路有无破损接地原因分析:接地保护线路动作,当交流电机驱动器检测到输出端子接地且接地电流大于交流电机驱动器额定电流的50%时,需要注意的是,这种保护是针对交流电机驱动器而不是人体的。故障排除:1、检查与电机的连接是否短路或接地。2、确定IGBT电源模块是否损坏。3、检查输出侧接线是否绝缘不良。扩展资料:当用变频器控制电机转速时,电机的温升和噪声会高于电网功率(工频);当电机低速运行时,由于电机风扇叶片转速低,注意通风降温和适当减负荷,避免电机温升超过允许值。电源线的阻抗不能太小,变频器与电网相连,当配电变压器容量大于500KVA或配电变压器容量大于变频器容量的10倍时,或由于回路阻抗小而将变频器连接到靠近配电变压器的地方时,变频器的输入会产生较大的浪涌,损坏变频器的整流元件。
2023-06-24 17:58:461

GFF男装是什么牌子啊

GFF:Gianfranco Ferre为年轻的X世代男女设计的副牌,风格摩登而个性。GFF的主牌如下(其实GFF就是GIANFRANCO FERRE的副牌,比如Eland集团旗下的牌子,或者nike旗下的Air Jordan):GIANFRANCO FERRE:Gianfranco Ferre是一个十分多产的设计师,他所设计的服装有五、六个系列,这是他最重要的正牌。这个牌子在港台地区有很重要的地位,不错。
2023-06-24 17:59:041

《王者荣耀》gff是什么意思?

gff是关菲菲的首字母,王者荣耀ggf就是王者荣耀关菲菲。《王者荣耀》gff是游戏玩家,gff所在的游戏随着天美工作室技术的升级有很多老皮肤迎来了优化,其中妲己的一款皮肤,gff使用的妲己女仆咖啡进行了优化,不光是gff使用的妲己这款皮肤,在关菲菲离开后的几款皮肤给玩家们的体验都好了很多,比如最近元芳的新皮肤,重做上线的艾琳新皮肤以及这次优化后的妲己皮肤。《王者荣耀》妲己皮肤打击普通攻击优化前每次普通攻击都会丢出一颗紫粉色的爱心,除了颜色稍微有些变化,其余和原皮基本没有区别,优化后改为丢一块巧克力奶油蛋糕。然后是一技能灵魂冲击。由原来的紫粉色冲击波改成了推出一张摆满甜品的桌子,有一种“妲己不想和你说话并扔了一桌子甜品”的感觉。二技能偶像魅力一直是妲己的核心技能,1.5秒的指向性控制是很多突进英雄的噩梦。在重做完后妲己会而丢出一杯妲己刚刚做好的咖啡,而且妲己还细心地制作了爱心拉花。
2023-06-24 17:59:271

请教G1F和GFF分别是什么意思

GFF GF G1F 分别是 Cover+ITO Film+ITO Film、Cover+ITO Film、 单面ITO Glass(一面做Cover外表面 一面做双层结构的一层)+ITO Film
2023-06-24 17:59:431

GTF与GFF文件格式的区别与转换

GTF与GFF文件都是用于存储注释信息的文本类型,经常可以看到二者格式之间的相互转换。二者的名字相似,连内容都极为相似,那么二者的差异究竟在哪里呢? GFF文件是一种用来描述基因组特征的文件,现在我们所使用的大部分都是第三版)(GFF3)。gff文件除gff1以外均由9列数据组成,前8列在gff的3个版本中信息都是相同的,只是名称不同。 第9列attributes的内容存在很大的版本特异性,9列信息(以gff3为例)分别是: GFF允许使用#作为注释符号,例如很多GFF文件都会使用如下的两行来表明其版本其创建日期: GFF文件每一列所代表的含义前面表格中有,但请注意,它的第3列 feature type 是不受约束的,你可以使用任意的名称,但也不要太淘气~用一些适当的名称对于后面的分析会有很大的帮助。 我们需要注意的是GFF文件的第9列,从第二版开始(GFF2),所有的属性都以 标签=值 的方式呈现,各个属性之间以 ; 作为分隔符 在最新版本的GFF文件中(GFF3),有一些是已经预先定义的属性特征,并且这些特征往往还有特殊的含义:ID这个标签实在各行都要有的;另外有一个Parent的属性,它指明type所从属的上一级ID。 当前所广泛使用的GTF格式为第二版(GTF2),它主要是用来描述基因的注释。GTF格式有两个硬性标准: gtf2的内容和gff3也是很相似的,区别只在其中的3列: 使用Cufflinks里面的工具"gffread": 脚本运行
2023-06-24 17:59:501

GFF电容触摸屏是什么意思?OGS全贴合技术和GFF有什么关系?

GFF技术和OGS技术是两种屏幕贴合技术,贴合工艺不同。OGS技术比GFF技术更好。但是相对来说GFF全贴合技术良品率比较高,成本比较低,目前有多款手机是采用GFF全贴合技术。工业电容屏定制行家,183的号,中间四位是2005 ,后面四位9375。全触通。 目前全贴合也分为三种技术 OGS TOL GFF三种全贴合技术。OGS(One glass solution):在保护玻璃上直接形成ITO导电膜及传感器的技术。一块玻璃同时起到保护玻璃和触摸传感器的双重作用 。从技术层面来看,OGS技术较之目前主流的G/G触控技术具备以下优势:结构简单,轻、薄、透光性好;由于省掉一片玻璃基板以及贴合工序,利于降低生产成本、提高产品良率。但目前该技术面临感应线路的制程选择、兼做表面玻璃时该有的强度维持与质量稳定性、控制芯片的调校等问题。GFF全贴合技术特点最为复杂,透光性较差,反光性大,但由于良品率最高,所以成本也是最低。
2023-06-24 17:59:592

关于手机屏幕的GFF的优缺点?

各有优缺吧,ogs结构较为简单,比gff薄,反光比gff要小,但是良品率比gff低,反之gff的特点就是反光较大,结构复杂,但是良品率高,所以是目前全贴合技术中成本较低的(主流中应该是最低),所以综合来看ogs的潜质要比gff大的多,手机党码字,原创。
2023-06-24 18:00:251

GFF 和 OGS 这两种触摸屏谁更好

GFF技术和OGS技术是两种屏幕贴合技术,贴合工艺不同。但是相对来说GFF全贴合技术良品率比较高,成本比较低,目前有多款手机是采用GFF全贴合技术。这是国内百科的解释,手机贴合工艺:GFF<OGS<TOL<on-cell<in-cell,良品率GFF>OGS>TOL>in-cell>on-cell,但是透光率,显示效果,屏幕厚度都较其他几种工艺差很多,一般使用在千元机以下,TOL良品率比OGS差,但是屏幕抗摔性比OGS好,以前魅族MX2使用过,现在几乎很少使用,从消费者角度来说,OGS透光性、触摸反应、亮度、息屏效果均比GFF 好,GFF的优势就是价格便宜
2023-06-24 18:00:342

台达变频器 一上电就显示报警0FF(有的说是GFF),这是什么情况?

属于接地故障,检查去电机的线路有无破损接地。原因分析:接地保护线路动作,当交流电机驱动百器检测到输出端子接地且接地电流大于交流电机驱动器额定电度流的50%时,需要注意的是,这种保护是针对交流电机驱动器而不是人体的。解决办法:1、检查与电机的连接是否短路或接地。2、确定IGBT电源模块是否损坏。3、检查输出侧接线是否绝缘不良。扩展资料:变频器常见故障检修:故障现象:变频器过流故障过电流故障一般可分为加速、减速和恒速过电流。主要原因是起动加速时间太短,负荷突然增加,逆变器输出短路,负荷分配不均,逆变器与电机容量不匹配,内部整流侧或逆变器侧元件损坏,电源缺相,输出断线,电机内部故障,接地故障。等。检修方法如下:故障检查时,先断开负载,检查变频器。如果在断开负载后仍然存在过电流故障,则意味着变频器的内部部件出现故障,需要进一步检查和维护。采取相应措施:延长加速时间,设计负荷分配,检查线路,防止干扰和机械振动,减少负荷突变。
2023-06-24 18:00:431

gff贴合技术的最外层的玻璃起什么作用?可以取下来吗?取下来对使用有什么影响?

GFF技术和OGS技术是两种屏幕贴合技术,贴合工艺不同。OGS技术比GFF技术更好。但是相对来说GFF全贴合技术良品率比较高,成本比较低,目前有多款手机是采用GFF全贴合技术,国产小米2A就是其中之一。最外层玻璃主要是了防护以及美观作用~~望采纳,谢谢
2023-06-24 18:00:581

怎么从fasta格式转换成gff格式

相关操作如下:1.DNAMAN将gbk中碱基序列复制,粘贴到DNAMAN的edit-entersequence的对话框,就ok2.DNAstar复制序列,打开DNAstar的Editseq程序,粘贴在那个空白对话框复制序列的时候,那些文字注释不要,可以有数字
2023-06-24 18:01:051

自然丝防脱育发液是真是假 好用吗?

自然丝防脱育发液是一种宣称能够促进头发生长和减少脱发问题的产品。然而,是否真的有效还需要根据个人情况来判断。自然丝防脱育发液通常是由多种植物提取物组成的,例如花椒、侧柏叶、当归、旱金莲、何首乌等。这些成分被认为可以刺激头皮的血液循环、加强头发根部的营养供应,从而促进头发的生长和减少脱发。此外,自然丝防脱育发液还宣称可以深层清洁头皮,控油去屑,修护受损的头发。然而,是否真的有效还需要根据个人情况来判断。有些人可能会发现使用自然丝防脱育发液后头发变得更加浓密,而有些人则可能发现没有明显的效果。因此,在使用之前,建议先了解自己的头发健康状况,正确的洗头方式和注意事项,以及产品的成分和用法。同时,如果在使用后没有看到明显的效果,也可以考虑咨询专业医生或发型师的意见,以确定其他的解决方案。
2023-06-24 18:01:122

谁能告诉我关于电容触摸屏的一些资料,急急急! 比如:GFF 、GG 都表示什么意思,

投射电容触控(简称电容屏或CTP)技术原理是以表面电容触控技术为概念,并将电极蚀刻成长条状以形成图案化电极,当手指接近时,控制器可迅速测知电容值改变,借以测得触控位置。由于生产大尺寸投射电容触控萤幕的难度高,因此目前主要应用于手机与PMP、NetBook、电子书、Tablet等中小尺寸手持式电子产品。投射电容技术是属于数位式侦测触控点技术,由于投射电容技术需先将电极图案化,因此可以一次侦测多点触控点讯号
2023-06-24 18:01:282

欧姆龙3G3mz变频器报警GFF是什么故障?

属于接地故障, 检查去电机的线路有无破损接地
2023-06-24 18:01:362

oncell与incell区别和G+FF

incell是三合一屏幕,技术最好。gff就是最一般的贴合屏。incell是三合一屏幕,技术最好;gff就是最一般的贴合屏。关于屏幕概念的炒作,从之前的IPS、AMOLED、SLCD的面板之争,到现在清一色标榜自己是OGS全贴合屏幕,如何轻薄、透光、图像“浮现”在屏幕上,苹果则貌似更为“高端”,传出了In-cell/On-cell的概念。做这期关于OGS/In-Cell/On-Cell屏幕的科普,力求通俗易懂。传统的G/G、GFF屏幕,都是标准的保护玻璃+触控层+显示面板层的结构,不同之处在于触控层。G/G屏幕的触控层是由1层ITO玻璃基板+1层ITO触控薄膜组成,GFF屏幕的触控层则有2层ITO玻璃基板+2层ITO触控薄膜(ITO:X和ITO:Y)。显然,G/G屏幕更薄一些。
2023-06-24 18:02:293

中达VFD-F变频器报GFF怎样维修

驱动板问题!我们有配件修 ,网址:广州通达变频器
2023-06-24 18:02:396

表带上刻有真皮的英文 表芯上是GFF这是什么牌子的手表啊

GianFranco Ferre (GFF) Designer Watch吉安弗兰科费雷(GFF)设计的手表
2023-06-24 18:03:051

iPad序列号是GFF

以G开头,代表生产地为上海和硕。苹果ipad序列号共12位,前3位字母为生产地代码,第四位为生产年份,六七八位为产品唯一识别符,第九和第十位为型号,第十一和十二位为颜色和容量。
2023-06-24 18:03:131

小米2A屏幕是GFF全贴合,那这种技术的屏幕会不会紧灰尘?

你好!不会进灰尘的。显示屏和触摸玻璃之间没有缝隙,是不会进灰尘的。仅代表个人观点,不喜勿喷,谢谢。
2023-06-24 18:03:202

步步高vivo手机内外屏是一体的吗?

是一体的。 vivo旗下有X系列、Xplay系列和Xshot系列的三大产品线布局,主要代表产品有vivo X5Pro、vivo X5Max、vivo X5、vivo Xshot、vivo Xplay3S、vivo X3V等。 一体屏又称为全贴合屏幕GFF技术和OGS技术是两种屏幕贴合技术,贴合工艺不同。但是相对来说GFF全贴合技术良品率比较高,成本比较低,目前有多款手机是采用GFF全贴合技术。
2023-06-24 18:03:294

黑莓q10屏幕是全贴合的吗

当然不是。GFF全贴合比非全贴合屏幕先进一点,只是把非全贴合屏幕中间玻璃基板的触控层改为薄膜基板(降低厚度),然后薄膜基板上下两面涂上导电涂层,这样可以大大降低整个屏幕厚度,提高屏幕的贴合度,所以严格来讲GFF全贴合并不是真正的全贴合,真正的全贴合技术是指把中间的触控层向上或者向下融合,向上和保护玻璃融合则是OGS或者TOL这一类全贴合,触控层向下融合则是苹果和三星用的Oncell和Incell技术。所以这么来说所谓全贴合技术就是将一般屏幕所有的三个部件(玻璃层、触控层和液晶层)其中某两个融合,减少部件数量和屏幕厚度,提高透光率,作为消费者我们只要知道最便宜的全贴合屏幕(比如国产千元手机所使用的)技术是GFF,中端的全贴合是OGS和TOL(TOL优于OGS),高端就是苹果用的Incell和三星用的Oncell(Incell优于Oncell)。
2023-06-24 18:03:591

#GTF/GFF格式# gffread入门使用

首先了解一下GTF/GFF的格式 https://asia.ensembl.org/info/website/upload/gff.html 两者的关系如下 安装如下: 程序是c++编写的因此并不需要预装一些包,当然也可以使用conda安装。 使用的例子如下: 程序非常简约,通过 man gffread 查看使用说明 github地址 https://github.com/gpertea/gffread
2023-06-24 18:04:061

gtf和gff3格式有什么不一样

我们在做生物分析的时候,经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件。他们有着相似的名字,甚至连内容都极为相似~那么,他们究竟差在哪里呢?GFF全称为general feature format,这种格式主要是用来注释基因组。GTF全称为gene transfer format,主要是用来对基因进行注释。
2023-06-24 18:04:131

变频器启动后显示GFF。然后电机就不转了。怎么回事。

啧啧啧看不懂
2023-06-24 18:04:452

s1100变频器字母代码GFF是什么意思?、 如何解决 求解!!!!

是什么牌子的。。有可能是接地
2023-06-24 18:04:572

2022-04-21fa文件和gff文件提取cds序列并翻译成蛋白

cat *.fa >hg19.fa #根据hg19.fa提取CDS序列 gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -y tr_cds.fa #翻译后蛋白序列 gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -x cds.fa #获得外显子序列 gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -w exons.fa #格式转换 gffread gencode.v19.annotation.gff3 -T -o gencode.v19.gtf gffread merged.gtf -o- > merged.gff3 用于记录 详见其他人: https://www.jianshu.com/p/c3f723c895fe
2023-06-24 18:05:151

GFF文件和基因组文件提取mRNA,cds,protein序列

首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,转录本序列 接下来我们利用组合工具来提取mRNA,和gene序列 a.gene.fa就是我们需要的文件,同理也可以得到a.mRNA.fa。 再利用提取最长转录本脚本,获得基因中最长可变剪切的序列。
2023-06-24 18:05:231

高达模型中MIA FIX(GFF) HCM-pro分别是什么

FIX系列成品模型,全称(GUNDAM FIX FIGURATION 也称GFF系列),绝大多数是在原机设上面做出改动的MS,有很多模型不曾推出的机体也相继在此系列登场,比例大多都为1/144,如果喜欢MSV的机体的人,也可以从此系列种获得自己想要的东西。FIX系列的涂装是成品系列里数一数二的,而且一般配件重多,全部零件摊开来是非常壮观的。一般具有多个换装模式,价钱也是成品中比较高的,但是可动性低。材料坚硬,比较有质感。要将一件模型完成到FIX系列的效果,至少要数天,所以买FIX系列成品模型还是一个很省事的选择。HCM Pro系列成品模型(High Complete Model Progressive)出厂时就已经组装完毕并基本涂装完成的成品系列模型。常见比例为1/200。造型和可动性都非常好。
2023-06-24 18:05:351

GFFFF是什么牌子

题主是否想询问“GFF是什么牌子吗”?GianfrancoFerre。1、GianfrancoFerre简称GFF。为年轻的X世代男女设计的副牌,风格摩登而个性。gianfrancoferre意大利的知名服装品牌。2、品牌以服饰为主,GFF包含Eland集团旗下的牌子,nike旗下的AirJordan。
2023-06-24 18:05:441

生物信息学常见数据格式

fasta 是一种 基于文本 用于表示 核酸序列 或 多肽序列 的格式。其中核酸或氨基酸均以单个字母来表示,且允许在序列前添加序列名及注释。 特征:2部分-- id行 和 序列行 。 > id行以“>”开头, 后跟序列名称&序列描述。有时候会包含注释信息 > 序列行一个字母表示一个 碱基/氨基酸 (A、T、C、G、N (N表示不知道是什么)/20种常见氨基酸)。序列中允许空格,换行,空行,直到下一个“>”,表示该序列结束。 高通量测序(如Illumina NovaSeq等测序平台)得到的原始图像数据文件,经碱基识别(Base Calling)分析转化为原始测序序列(Sequenced Reads),我们称之为Raw Data或Raw Reads,结果以FASTQ(简称为fq)文件格式存储,其中包含测序序列(Reads)的 序列信息 以及其对应的 测序质量信息 。测序样品中真实数据随机截取结果如下图: 特征: 每4行代表一个reads信息 fastq格式是由fasta (记录id和序列) 和QUAL (记录id和碱基质量) 合并而来。fastq文件第三行往往是个+,其实就是和第一行一样都是id。 第四行碱基质量值 碱基质量值(Quality Score或Q-score)是碱基识别(Base Calling)出错的概率的整数映射。通常使用的碱基质量值Q公式[1]为: Q=-10 * log10P 。其中P为碱基识别出错的概率。下表给出了碱基质量值与碱基识别出错的概率的对应关系。 碱基质量值越高表明碱基识别越可靠,准确度越高。比如,对于碱基质量值为Q20的碱基识别,100个碱基中有1个会识别出错,以此类推。 碱基质量值+33(前32个不是单个值),查表找到对应ASCII码 fastq与fasta文件转换 GFF,全称为Generic Feature Format,主要用来描述 基因的结构与功能信息 ,对基因组进行注释。记录序列中转录起始位点、基因、外显子、内含子等组成元件在染色体中的位置信息。现在用得比较多的是第3版,即gff3。gff是一个三级嵌套结构。格式文件为文本文件,分为9列,以TAB分开。控制符使用RFC 3986 Percent-Encoding 编码。比如:%20 代表着ASCII的空格。 gff文件一共有9列: 第九列的详解 GTF全称为gene transfer format,主要是用来对基因进行注释。现在用得比较多的是第2版,即gtf2。gtf文件也是分为9列,前八个字段与GFF相同(有一些小的差别),重点在第九列的不同。 两种文件差异比较: bam文件和sam文件内容其实是一样的,只是bam是二进制的压缩文件,占内存空间更小。需要通过特定的软件来进行查看。(sam文件可以直接使用 less -S 查看;bam文件使用 samtools view -h xxx.bam | less -S 查看) SAM(The Sequence Alignment / Map format)格式,即序列比对文件的格式,详细介绍文档: http://samtools.github.io/hts-specs/SAMv1.pdf SAM文件由两部分组成,头部区和主体区,都以tab分列。 头部区 :以"@"开始,体现了比对的一些总体信息。比如比对的SAM格式版本,比对的参考序列,比对使用的软件等。 主体区 :比对结果,每一个比对结果是一行,有11个主列和一个可选列。 头部区: @HD VN:1.0 SO:unsorted (排序类型) 头部区第一行:VN是格式版本;SO表示比对排序的类型,有unknown(default),unsorted,queryname和coordinate几种。samtools软件在进行行排序后不能自动更新bam文件的SO值,而picard却可以。 @SQ SN:contig1 LN:9401 (序列ID及长度) 参考序列名,这些参考序列决定了比对结果sort的顺序,SN是参考序列名;LN是参考序列长度;每个参考序列为一行。 例如:@SQ SN:NC_000067.6 LN:195471971 @RG ID:sample01 (样品基本信息) Read Group。1个sample的测序结果为1个Read Group;该sample可以有多个library的测序结果,可以利用bwa mem -R 加上去这些信息。 例如:@RG ID:ZX1_ID SM:ZX1 LB:PE400 PU:Illumina PL:Miseq ID:样品的ID号 SM:样品名 LB:文库名 PU:测序以 PL:测序平台 这些信息可以在形成sam文件时加入,ID是必须要有的后面是否添加看分析要求 @PG ID:bowtie2 PN:bowtie2 VN:2.0.0-beta7 (比对所使用的软件及版本) 例如:@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.12-r1039 CL:bwa sampe -a 400 -f ZX1.sam -r @RG ID:ZX1_ID SM:ZX1 LB:PE400 PU:Illumina PL:Miseq …/0_Reference/Reference_Sequence.fa ZX_HQ_clean_R1.fq.sai ZX_HQ_clean_R2.fq.sai …/2_HQData/ZX_HQ_clean_R1.fq …/2_HQData/ZX_HQ_clean_R2.fq 这里的ID是bwa,PN是bwa,VN是0.7.12-r1039版本。CL可以认为是运行程序@RG是上面RG表示的内容,后面是程序内容,这里的@GR内容是可以自己在运行程序是加入的 主体部分介绍: 主体部分有11个主列和1个可选列 FLAG详解: http://broadinstitute.github.io/picard/explain-flags.html 例如:想要查看FLAG 99是什么意思:samtools flags 99 CIGAR详解 CIGAR string,简要比对信息表达式(Compact Idiosyncratic Gapped AlignmentReport),其以参考序列为基础,使用数字加字母表示比对结果,比如3S6M1P1I4M,前三个碱基被剪切去除了,然后6个比对上了,然后打开了一个缺口,有一个碱基插入,最后是4个比对上了,是按照顺序的,字母的含义如下 sam/bam文件查看 samtools工具: http://www.htslib.org/doc/samtools.html Samtools常用命令的总结: https://www.bioinfo-scrounger.com/archives/245/ https://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/6805373.html 参考: sam格式文件解读
2023-06-24 18:05:541

Biopython之gbff转gff格式 2020-04-27

先安装Biopython,见前篇随笔 再安装 bcbio-gff pip install bcbio-gff Google是法宝,直接搜索 UnicodeDecodeError: "utf-8" codec can"t decode byte 0x8b in position 1: invalid start byte ,得到如下解,见 stackoverflow 修改新的对应文件名后再运行脚本 python gbff2gff3.py 于是得到以下 替换方法: https://github.com/jorvis/biocode/blob/master/gff/convert_genbank_to_gff3.py 总结:转换后并不能得到直接可用的完整注释文件,建议直接搜索已有的注释文件
2023-06-24 18:06:031

如何通过gff文件中的exon位置从基因组中提取序列 并把同一个转录本的exon合并起来

你好可以用linux命令,grep抓取exon关键词,根据位置信息,bedtools命令提取序列
2023-06-24 18:06:131

台达变频器显示GFF是什么意思?

属于接地故障,检查去电机的线路有无破损接地原因分析:接地保护线路动作,当交流电机驱动器检测到输出端子接地且接地电流大于交流电机驱动器额定电流的50%时,需要注意的是,这种保护是针对交流电机驱动器而不是人体的。故障排除:1、检查与电机的连接是否短路或接地。2、确定IGBT电源模块是否损坏。3、检查输出侧接线是否绝缘不良。扩展资料:台达变频器的常见故障代码如下:(1)OC报警,键盘面板LCD显示:加、减、恒速时过电流。(2)OLU报警,键盘面板LCD显示:变频器过负载。(3)OU1报警,键盘面板LCD显示:加速时过电压。(4)LU报警,键盘面板LCD显示:欠电压。(5)EF报警,键盘面板LCD显示:对地短路故障。G/P9系列变频器出现此报警时可能是主板或霍尔元件出现了故障。(6)Er1报警,键盘面板LCD显示:存贮器异常。(7)Er7报警,键盘面板LCD显示:自整定不良。
2023-06-24 18:06:351

基因组注释文件(二)| gff 和 gtf文件格式说明

GFF和GTF是两种最常用的基因组注释格式,在信息分析中建库时除了需要fasta文件一般还会需要这两种文件,提取需要的信息进行注释。 GFF(General Feature Format)是一种用来描述基因组特征的文件,现在我们所使用的大部分都是第三版(gff3)。 gff文件除gff1以外均由9列数据组成,前8列在gff的3个版本中信息都是相同的,只是名称不同: gtf文件是以tab键分割的9列组成,以下为每一列的对应信息: 在GFF文件的开头,可以有#开头的注释行,示例如下 对于不同的基因组特征,其属性不同。 染色体是基础,后续的基因,exon等都是需要定位在染色体上的。 假基因示例如下 tRNA基因示例如下 miRNA基因示例如下 一个miRNA基因的最终会形成两个成熟的miRNA。 lncRNA基因示例如下 需要注意是,由于可变剪切的存在,一个蛋白编码基因可能会有多个转录本。 查看第9列有哪些注释信息: gtf全称为gene transfer format,主要是用来对基因进行注释,当前所广泛使用的gtf格式为第二版(gtf2)。以下均基于gtf2叙述。 gtf同gff3很相似,也是9列内容,其内容如下: 例子: GFF 全称为general feature format,这种格式主要是用来 注释基因组 。 GTF 全称为gene transfer format,主要是用来对 基因 进行注释。 GTF 的第九列,通常为: 而 GFF 的第九列,通常为: 目前两种文件可以方便的 相互转化 :使用 gffread UCSC GTF format https://blog.csdn.net/sinat_38163598/article/details/72851239
2023-06-24 18:06:471

请教G1F和GFF分别是什么意思

GFF GF G1F 分别是 Cover+ITO Film+ITO Film、Cover+ITO Film、单面ITO Glass(一面做Cover外表面 一面做双层结构的一层)+ITO Film
2023-06-24 18:07:001

GFF是什么意思

GFF n. 人造石铺地面图形文件格式
2023-06-24 18:07:081

买了件衣服牌子是GFF,这个品牌全称是啥???

意大利Gianfranco Ferre詹弗兰科
2023-06-24 18:07:172

台达变频器显示GFF是什么意思

属于接地故障,检查去电机的线路有无破损接地原因分析:接地保护线路动作,当交流电机驱动器检测到输出端子接地且接地电流大于交流电机驱动器额定电流的50%时,需要注意的是,这种保护是针对交流电机驱动器而不是人体的。故障排除:1、检查与电机的连接是否短路或接地。2、确定IGBT电源模块是否损坏。3、检查输出侧接线是否绝缘不良。扩展资料:当用变频器控制电机转速时,电机的温升和噪声会高于电网功率(工频);当电机低速运行时,由于电机风扇叶片转速低,注意通风降温和适当减负荷,避免电机温升超过允许值。电源线的阻抗不能太小,变频器与电网相连,当配电变压器容量大于500KVA或配电变压器容量大于变频器容量的10倍时,或由于回路阻抗小而将变频器连接到靠近配电变压器的地方时,变频器的输入会产生较大的浪涌,损坏变频器的整流元件。
2023-06-24 18:07:241

台达变频器 一上电就显示报警0FF(有的说是GFF),这是什么情况?

电机有对地短路故障,用摇表检查电机和连线。
2023-06-24 18:07:435

自然丝防脱育发液靠谱吗 管用吗?

自然丝育发液有用吗自然丝防脱育发液比较不错的,一般来说是有用,易掉发,也有可能跟你错误洗头有关。洗头发跟护肤一样,必须从基本的清洁工作做起,后续的滋养才能够有效吸收。正确的洗头步骤应该是:将洗发液置于掌心,揉戳起泡后再抹于发上,由发根洗至发尾,并让头发成自然垂下,使用指腹来轻推按摩头皮各处,来回两三次,接下来以流动的温和清水徐徐冲洗,勿使用太烫的热水,会导致头皮过度干燥。洗完后,尽量用毛巾把水分吸干,然后将护发素涂抹在耳朵以下的头发上,等到头发变得柔顺后,再用清水将护发素彻底冲洗干净,并用毛巾包裹头部,让护发素的保湿成分得以完全发挥。另外,要注意的一点是,洗发后应先用毛巾拍干头发上的多余水分,用手轻轻梳理后,再用吹风机吹发,以免因头发纠结而造成损伤。自然丝是由李时珍国药集团专项研发的成果,并且精挑细选多重天然草本精粹而成,(花椒:抑制真菌,滋养头皮,修复毛囊,增加毛囊韧性;侧柏叶:促进头皮血液循环,减少毛囊细胞死亡,促进毛发生长;何首乌:温和滋养头皮,强根健发,乌发固发;当归:滋润皮肤毛发,并使头发乌黑发亮,防止黄发和白发。)并利用国际一流超临界低温萃取工艺在这些成分中提取出“GFF”的生发元素,“GFF”作为焕活毛囊的关键因子,它能迅速唤醒沉睡的毛囊,恢复毛囊育发功能,持续不断地发育成新的健康毛发。
2023-06-24 18:08:281

买了件衣服牌子是GFF,这个品牌全称是啥???

以上说的没错.但GFF是此设计师的副牌.
2023-06-24 18:08:372

自然丝育发液怎么样啊 真的好吗?

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2023-06-24 18:08:551

自然丝防脱育发液有效果吗?

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2023-06-24 18:09:031

如何合并多个gff3基因注释文件

方法/步骤首先打开KEGG搜索界面。Searchagainst输入"hsa",PrimaryID类型选择“NCBI-GeneID”,在“Enterobjectsoneperlinefollowedbybgcolor,fgcolor”下方文本框中输入要查询的基因名“GPX1”。在“Examples”下方选择“人”的通路。
2023-06-24 18:09:091

自然丝育发液到底好不好呢?

自然丝育发液有用吗自然丝防脱育发液比较不错的,一般来说是有用,易掉发,也有可能跟你错误洗头有关。洗头发跟护肤一样,必须从基本的清洁工作做起,后续的滋养才能够有效吸收。正确的洗头步骤应该是:将洗发液置于掌心,揉戳起泡后再抹于发上,由发根洗至发尾,并让头发成自然垂下,使用指腹来轻推按摩头皮各处,来回两三次,接下来以流动的温和清水徐徐冲洗,勿使用太烫的热水,会导致头皮过度干燥。洗完后,尽量用毛巾把水分吸干,然后将护发素涂抹在耳朵以下的头发上,等到头发变得柔顺后,再用清水将护发素彻底冲洗干净,并用毛巾包裹头部,让护发素的保湿成分得以完全发挥。另外,要注意的一点是,洗发后应先用毛巾拍干头发上的多余水分,用手轻轻梳理后,再用吹风机吹发,以免因头发纠结而造成损伤。自然丝是由李时珍国药集团专项研发的成果,并且精挑细选多重天然草本精粹而成,(花椒:抑制真菌,滋养头皮,修复毛囊,增加毛囊韧性;侧柏叶:促进头皮血液循环,减少毛囊细胞死亡,促进毛发生长;何首乌:温和滋养头皮,强根健发,乌发固发;当归:滋润皮肤毛发,并使头发乌黑发亮,防止黄发和白发。)并利用国际一流超临界低温萃取工艺在这些成分中提取出“GFF”的生发元素,“GFF”作为焕活毛囊的关键因子,它能迅速唤醒沉睡的毛囊,恢复毛囊育发功能,持续不断地发育成新的健康毛发。
2023-06-24 18:09:161

求教,GG,GF,GFF,OGS,ON cell,in cell 这些类型CTP 的优缺点

这个题目有点大,需要了解详细的,建议看专题的报告和资料;总体来说,从几个方面看1、厚度:GG>GFF>GF>OGS>On-cell>In-cell2、透光率:GFF<GF<GG<OGS<On-cell<In-cell3、工艺难度:GG<GF<GFF<OGS<On-cell<In-cell目前大的趋势LCD屏幕走In-cell,AMOLED走On-cell。
2023-06-24 18:09:231

自然丝防脱育发液靠谱吗?

吃药治疗脱发
2023-06-24 18:09:302

gff文件太大打不开怎么办

是gif吧,用flash打开就行了。flash cc 2015安装破解教程注意:安装软件之前请先断开网络,可以直接拔掉网线。1、在本站下载好安装包,得到如下图所示的这些文件,运行“Flash_Professional_15_LS20.exe”解压缩软件。2、建议不要更改目录,点击“下一步”。3、解压成功后会弹出下面这样的界面,点击“忽略”,然后继续安装。4、以试用的方式安装。5、出现登录页面,点击“登录”。6、由于我们断开了网络,所以是登不上的,点击“以后登录”。7、软件许可协议,点击“接受”。8、语言选择可以根据你自己的需求进行选择,安装位置不仅以更改。9、由于软件比较大,安装需要时间,请耐心等待。10、安装成功 flash cc 2015:http://www.xue51.com/soft/1201.html
2023-06-24 18:09:381