barriers / 阅读 / 详情

maftools包计算TMB值

2023-08-25 07:13:34
共1条回复
皮皮

之前看文章很多人用perl语言计算TMB值,用R软件的maftools包也可以计算。

perl计算得到的和R的maftool包计算得到的TMB值之间是否存在不同,解螺旋挑圈联靠比较了两组计算方法的TMB值之间的相关性,可以参考:

x第三列就是TMB值了,可以用四分位数看看tmb值的分布情况:

不取TMB log值,则设为F

收工。

相关推荐

TMB是什么意思?

3,3",5,5"-四甲基联苯胺 ,一种新型安全的色原试剂;TMB逐步取代强致癌物联苯胺和其他致癌性的联苯胺衍生物,是目前过氧化酶的新底物(供氢体),在酶免疫分析法(EIA)和酶联免疫吸附检验法(ELISA)中获得了广泛的应用。TMB受光照的影响不大,可在室温中置于操作台上,边反应边观察结果。但为保证实验结果的稳定性,宜在规定的时间阅读结果。TMB经辣根过氧化物酶(HRP)作用后,约40分钟显色达顶峰,随即逐渐减弱,至2小时后即可完全消退至无色。TMB的终止液有多种,叠氮钠和十二烷基硫酸钠(SDS)等酶抑制剂均可使反应终止。这类终止剂尚能使蓝色维持较长时间(12-24小时)不褪,是目视判断的良好终止剂。此外,各类酸性终止液则会使蓝色转变成黄色,此时可用特定的波长(450nm)测读吸光值。
2023-08-19 17:35:292

tmb显色反应原理

答案如下:TMB是一种优于0PD的新型HRP色原底物。其氧化产物联苯醌在波长450nm处有最大消光系数,假如HRP量少,过氧化氢溶液和TMB过量时,则形成蓝色的阳离子根。降低pH,即可使蓝色的阳离子根转变为黄色的联苯醌。显色反应是将试样中被测组分转变成有色化合物的化学反应。在无机分析中,很少利用金属水合离子本身的颜色进行光度分析,因为它们的吸光系数值都很小。一般都是选适当的试剂,将待测离子转化为有色化合物,再进行测定。这种将试样中被测组分转变成有色化合物的化学反应,叫显色反应。显色反应有氧化还原反应和配位反应。显色反应能否满足光度法的要求,除了主要与显色剂的性质有关系外,控制好显色反应的条件也是十分重要的。显色条件包括显色剂用量、酸度、显色温度、显色时间及干扰的消除。TMB溶液;TMB游离酸;四甲基联苯二胺;TMB游离酸溶液;钡硫氰酸盐三水合物;四甲基联苯胺,TMB;A B双液 TMB显色液;四甲基联苯胺盐酸盐 二水;3,3",5,5"-四甲基联苯胺;3,3,5,5-四甲基联苯胺溶液
2023-08-19 17:35:471

TMB加硫酸由蓝变黄原理

TMB,即3,3′,5,5′-Tetramethylbenzidine,是辣根过氧化物酶的常用底物。在辣根过氧化物酶或其他适当过氧化物酶的催化下,TMB会产生可溶性蓝色产物。蓝色产物通常可以在370nm或620-650nm测定吸光度。辣根过氧化物酶催化TMB显蓝色后可以使用2M H2SO4终止反应。加入硫酸后,溶液呈黄色,此时可以在450nm测定吸光度。
2023-08-19 17:36:081

肿瘤TMB的计算原理和数学模型

美国FDA目前批准了3个检测肿瘤TMB( tumor mutation burden)的方法:Omisc Core WES、MSK-IMPACT、FMI。如果按实验流程及操作复杂度来讲,这可能是有史以来最复杂的病理诊断方法。流程一般如下:手术取样、提取DNA、建测序文库、靶向捕获、NGS测序、数据比对、变异检测、变异注释、结果解读。复杂方法下的简单目的:数一数肿瘤特有的变异有几个,多数情况下平均每100万个位点还不超过10个变异。 TMB定义是:每Mb区域里非同义的体细胞变异个数。 有效覆盖区域L容易知道,如果覆盖度足够好,可以用bed文件区间长度代替,那么计算TMB主要的工作就是怎么计算somatic。在肿瘤基因检测中计算somatic处于最核心的位置,靶向治疗、免疫治疗等都围绕着somatic展开。 Somatic定义为个体生长过程中产生的变异。目标就是要找在测序中肿瘤组织测到而正常组织没有测到的变异。因为测序有错误,如果测序足够深,肿瘤及正常组织大多数位点都会有变异。那么通过判断正常组织有无变异将不适合。我们可以模型化为肿瘤组织与正常组织某一变异有相同的频率为种系变异germline,否则为somatic。方法是对肿瘤组织及正常组织同时外显子靶向高通量测序,对每个位点进行比较。通过测序深度、频率等参数比较判断是否somatic。业内有很多计算软件可以用来计算somatic。下表是业内使用最多的开源软件[1],现在选取业界使用最多的VarScan2 的算法来介绍somatic及其TMB的计算原理。 表1 热门软件采用的数学模型 以下是VarScan2输出VCF格式文件位点的结果 SPV=8.8337E-2是用Fisher"s Exact Test计算的P-value值,用来判断是否somatic。那这值是怎么计算得到的,源文献没有具体说明,本人在这里给出计算过程。Fisher"s Exact Test接受2×2行列表作为计算对象,从上述结果提取数据可以得到下表。 表2. 肿瘤样本与正常样本覆盖深度2×2行列表。RD: 支持参考序列的碱基数;AD: 支持变异的碱基数。 Fisher"s Exact Test接受2×2行列表作为输入,并按如下方式计算P-value值: 1、计算行列表中每一行,每一列的总和以及观察总数。 2、给定行和列总和,如果原假设为真,则使用超几何概率函数计算条件概率,以观察行列表中的准确结果。条件概率为 其中R1和R2是行总和,C1和C2是列总和,N是行列表中观测的总数,nij是表中第i行和第j列的值。 3、查找与行和列之和一致的所有可能的非负整数矩阵。对于每个矩阵,使用P公式计算相关的条件概率。 4、根据感兴趣的替代假设,使用这些值来计算检验的p值。 (1)对于双边测试,对于观察到的行列表,将所有小于或等于Pcutoff的条件概率求和。 (2)对于左侧测试,将(1,1)象限频率小于或等于n11的所有矩阵的条件概率求和。 (3)对于右侧测试,在观察到的行列表中求和(1,1)单元频率大于或等于n11的所有矩阵的条件概率。 VarScan2 somaitc计算的是单侧测试,如果按下表排列数据是左侧测试。 表2. 肿瘤样本与正常样本覆盖深度2×2行列表。 那怎么计算P-value呢?根据P-value的定义:在原假设为真的前提下,出现该样本或比该样本更极端的结果的概率之和。上表就是所有tumor Ref depth小于等于47的概率之和。 (P根据公式1计算) P-value=0.0883,这P的意思是假设tumor Alt与normal Alt有同样的频率,但这的假设可能性为0.0883。按通常0.05或0.01阈值来cutoff的话,应该接受这一假设。肿瘤样本中测到的位点是种系变异而非somatic。 再看一个测序位点 表3.肿瘤样本与正常样本覆盖深度2×2行列表。 P-value=1.3226e-15,这P值就足够小,认为是种系变异就不合适了,可以判断为肿瘤特有的变异somatic。 按照上述方法对肿瘤样本与正常样本所有同时覆盖的位点都计算一个P-value值,当P-value值小于设定值时判定位肿瘤体细胞变异。因影响NGS测序结果的因素多,reads覆盖的概率分布并不跟理想模型一致。如果按照常见0.05值来判定somatic,结果会比预期多。可以通过更低的P-value值或其他条件过滤掉可能的假阳性位点。按本人计算经验,P-value设0.001跟mutect2设的默认参数差不多。如果somatic是10个,覆盖到的区域2M,那么TMB=10/2=5。 参考资料
2023-08-19 17:36:161

什么是“tmb”格式,如何打开?

一种复读学习机的专用格式不知道回答的你了解了没!
2023-08-19 17:36:264

肿瘤突变负荷TMB结果是12.00mutations/mb是什么意思?

肿瘤突变负荷,英文缩写为TMB,是采用第二代基因测序技术,检测到的一份肿瘤样本中,所评估基因的外显子编码区,每百万碱基中发生置换,和插入/缺失突变的总数。通俗一点说,肿瘤突变负荷,就是评价基因突变频率高低的指标。肿瘤细胞基因突变频率高,则细胞表面,所携带的肿瘤抗原就多,容易受到机体免疫系统的攻击,而被杀死。因此,检测恶性肿瘤的肿瘤突变负荷,就可以预测患者对免疫治疗的效果,目前已成为临床上,预测癌症免疫治疗疗效的、具有良好前景的全新生物标志物。12属于中等突变吧。
2023-08-19 17:36:341

tmb为什么需要现配现用吗

避免污染。TMB显色液市场上可以买得到的,分A液和B液,用的时候直接按比例混合就可以用了,如果提前配好存放太长时间的话,会使得溶液中的物质变质,以及氧化等问题,导致实验的时候没办法达到自己想要的效果。TMB中文名是3355四甲基联苯胺,为白色结晶粉末,无嗅,无味,难溶于水,易溶于丙酮,乙醚,二甲亚砜,二甲基甲酰胺等有机溶剂一种新型安全的色原试剂。
2023-08-19 17:36:421

tmb检测羟基自由基原理

tmb颜色反应检测羟基自由基的产生,其原理是羟基自由基可以使tmb发生颜色反应(由无色变为蓝色或黄色)。羟基自由基使得探针发生显色反应,会使溶液从无色变成黄色或蓝色,其对应特征峰的吸收值会越来越高。
2023-08-19 17:36:511

TMB是什么意思啊?

骂人的话 【【【 他妈的】】】 3,4,5-三甲氧基苯甲醛(TMB)是一种重要的医药中间体,在医药工业上主要用于磺胺增效剂甲氧苄氨嘧啶(TMP)、镇咳祛痰药喘速宁、抗癫痫药3,4,5-三甲氧基肉桂酰异丙胺以及辅酶Q10的主环原料。
2023-08-19 17:36:591

TMB动力学的常数是多少

常数为240.34。TMB是一种过氧化物酶底物,是HRP检测常用的显色底物。TMB的不同动力学配方可用于优化不同的应用。
2023-08-19 17:37:181

什么叫TMB

TBM中文名为:全断面隧道掘进机,又称为全断面掘进机;也译作全断面(隧道)钻掘机,英文缩写为TBM,是专门用在开凿隧道的大型机具。该机具具有一次开挖完成隧道的特色,从开挖、推进、撑开全由该机具完成,开挖速度是传统钻炸工法的5倍。然而该机具完全无法模组化,通常是依照开挖隧道的直径订作,价格也非常昂贵。
2023-08-19 17:37:281

TMB带有正电荷吗

是的。TMB本身就带有正电荷,不溶于水,易溶于有机溶液,通过游离的电子可以很好的适用于显色反应。用丝绸摩擦过的玻璃棒所带的电荷叫做正电荷,质子是正电荷,而正电荷不一定是质子。
2023-08-19 17:37:361

过氧化氢在tmb显色反应中的作用

TMB和过氧化氢在辣根过氧化物酶(HRP)的催化下形成oxTMB,是蓝色
2023-08-19 17:37:451

天猫魔盒tmb100c参数

处理器Cortex-A9,双核1.5GHz图形处理器:两颗Mail-400输出分辨率支持HDMI:576P,720P,1080i,1080P支持CVBS:480i,576i 音频播放音频解码:支持MPEG-1 layer Ⅰ/Ⅱ/Ⅲ,WMV,PCM,AACLC,AACHE,AACMain等 视频播放视频解码:支持H.263,H.264,MPEG-2,MPEG-4,WMV,Real等主流格式,支持AVI,3GP,MP4,MOV,FLV,WMV,RMVB,ASF,MKV等封装格式 内存1GB DDR3 闪存4GB
2023-08-19 17:38:121

tmb显色实验最佳时间

使用方法用适当的干净容器(用纯净水反复冲洗),倒出适量的单组分TMB显色液,待达到室温后即可使用。加液:加完HRP结合物并孵育一定时间后,用适当洗涤液洗板3-5次,每孔加TMB显色液100ul。 根据个人实验需要,在室温(15-25℃)或37℃下避光温育10-30分钟或更长时间,直至显色至预期深浅。终止:加入等体积的1M 盐酸或硫酸溶液终止反应,孔中反应液由蓝色变为黄色。读数:终止反应后30分钟内在450nm处测定吸光值。注意:如果出现高的反应背景或沉淀,表明TMB底物反应过于强烈。为了避免产生沉淀,可在终止后马上读数;或者进一步稀释一抗和/或HRP结合物。背景知识目前酶免疫分析(EIA)技术,已被广泛应用于抗原,半抗原或抗体的定量或定性检测分析。辣根过氧化物酶(HRP)及其偶联物是酶联免疫分析技术中常用的一种酶,由于3,3",5,5"-四甲基联苯胺(TMB)在HRP的显色反应体系中,比其它色原具有更高的灵敏度且无致癌性而被广泛应用。TMB主要应用于酶联免疫吸附实验(ELISA),免疫斑点杂交或者免疫组化以及氯和过氧化氢的检测分析。为了满足不同的试剂盒产品研发与生产以及科研需求,本公司专门研制了针对不同类型的基于HRP的免疫分析用TMB显色液
2023-08-19 17:38:201

tmb基因是什么意思

肿瘤突变负荷(TMB)被定义为每百万碱基中被检测出的,体细胞基因编码错误、碱基替换、基因插入或缺失错误的总数。
2023-08-19 17:38:301

TMB在轴承行业里是什么意思呢?

天马轴承
2023-08-19 17:38:402

求助ELISA实验中,显色液B TMB如何稳定

HRP底物:TMB--H2O2系统。经多年使用比较如下:国外商品化(双组份与单组份比较):双组份的灵敏度比较高,保存时间也很长(一般4度放3-5年没有问题),单组份的要差一些。国内的:商品化的双组份灵敏度和保存时间与进口大公司的相当;单组份的:哈哈。
2023-08-19 17:39:001

tmb显色时间多长时间

在室温(15-25℃)或37℃下避光温育10-30分钟或更长时间,直至显色至预期深浅。。TMB显色液是一种采用了最新单一溶液TMB显色技术,通过辣根过氧化物酶(HRP)催化TMB显色,用于ELISA等的显色液。本显色液也可以用于检测血液或血红蛋白等样品中的过氧化物酶含量。
2023-08-19 17:39:071

您好 您的TMB显色液的配制方法可以告诉我吗 ?

试试我的配方吧:底物显色A液:醋酸钠13.6g ,柠檬酸1.6g,30%双氧水0.3ml,蒸馏水加至500ml.底物显色B液 :乙二胺四乙酸二钠0.2g,柠檬酸0.95g,甘油 50ml,取0.15g TMB溶于3mlDMSO中,蒸馏水加至500ml.注意避光保存,使用的时候根据需要量取等量AB液混匀后使用,如果用量小的话建议AB液各配100ml就绰绰有余了。 TMB水溶解性不好,所以要溶于有毒的DMSO或者乙醇中,如果改用TMB*HCl,则可直接溶于水中,如果TMB质量不理想出现大量不溶现象的话就稍微增加TMB的量,一般而言也不影响显色的(个人经验)。我配出来的显色效果一点都不必名牌显色试剂盒差哦:)
2023-08-19 17:39:171

酶催化TMB偏绿的原因

1、酶催化TMB偏绿的原因是TMB会产生可溶性蓝色产物。蓝色产物通常可以在370nm或620-650nm测定吸光度。2、辣根过氧化物酶催化TMB显蓝色后可以使用2MH2SO4终止变绿反应。
2023-08-19 17:39:241

tmb与过氧化氢反应原理

tmb与过氧化氢反应原理:H2O2会给反应中的其他物质提供电子或吸收电子。因为-1价的O既能升价又能降价,所以既有氧化性又有还原性,既能得电子又能失电子。氧化性:遇到还原性强的物质与之反应,过氧化氢作为氧化物被还原从还原剂中得电子。H2O2的氧化产物为O2发生中和反应,生成氢过氧化钠 此外,过氧化氢在碱性介质中分解速率快 双氧水和氢氧化钠可以发生中和反应 H2O2+NaOH=NaHO2+H2O NaHO2+NaOH=Na2O2+H2O H2O2的酸性比水要强,它的水溶液是一种弱酸,因此会与NaOH发生中和反应。应用领域通常将过氧化氢配制成水溶液双氧水使用。双氧水的用途分医用、军用和工业用三种,日常消毒的是医用双氧水,医用双氧水可杀灭肠道致病菌、化脓性球菌,致病酵母菌,一般用于物体表面消毒。 双氧水具有氧化作用,但医用双氧水浓度等于或低于3%,擦拭到创伤面,会有灼烧感、表面被氧化成白色并冒气泡,用清水清洗一下就可以了,过3-5分钟就恢复原来的肤色。以上内容参考:百度百科-过氧化氢
2023-08-19 17:39:321

怎样检测TMB?可以通过采血检查么?

可以通过血液检查TMB,目前大部分都是通过采集肿瘤组织检测TMB,听说裕策生物自主研发的液体活检TMB检测产品YucebTMB可以通过采血检查TMB,
2023-08-19 17:39:512

BTS50085-1TMB和BTS50085-1TMA区别

开门设计以及容量都有区别。1、开门设计:BTS50085-1TMB冰箱采取双开门设计,比较传统化。BTS50085-1TMA采取三开门设计,设计比较新颖。2、容量:BTS50085-1TMB冰箱容量较小是传统规模。BTS50085-1TMA容量在传统的基础上进行了扩展,容量较大。
2023-08-19 17:39:591

天猫魔盒tmb100c没有遥控器怎么启动

手机下载个悟空遥控试试
2023-08-19 17:40:093

tmb在elisa中起什么作用,使用时应注意哪些事项

TMB显色液是一种采用了最新单一溶液TMB显色技术,通过辣根过氧化物酶(HRP)催化TMB显色,用于ELISA等的显色液。TMB对人体有刺激性,请注意适当防护,如果发现TMB显色液出现混浊或颜色变成较深的蓝色,应该停止使用。为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
2023-08-19 17:40:251

TMB与过氧化氢配比

TMB配方 使用的TMB配方:TMB储备液:60mgTMB溶于10mL DMSO 柠檬酸 0.1M 磷酸氢二钠 0.2M 显色液:TMB储备液:0.125ml 柠檬酸:2.5ml 磷酸氢二钠:2.5ml 二次水:5ml 30%双氧水
2023-08-19 17:40:351

基因检测肿瘤突变负荷(TMB)预测PD-1靠谱吗?

这项研究早就落实下来的,还是比较有用的。
2023-08-19 17:40:575

tmb显色什么时候终止

净容器用纯净水反复冲洗。用适当的干净容器用纯净水反复冲洗,倒出适量的单组分TMB显色液,待达到室温后即可使用。加液:加完HRP结合物并孵育一定时间后,用适当洗涤液洗板3-5次,每孔加TMB显色液100ul。根据个人实验需要,在室温15-25℃或37℃下避光温育10-30分钟或更长时间,直至显色至预期深浅。终止:加入等体积的1M盐酸或硫酸溶液终止反应,孔中反应液由蓝色变为黄色。读数:终止反应后30分钟内在450nm处测定吸光值。
2023-08-19 17:41:141

四甲基联苯胺血检原理

中文名称:3,3",5,5"-四甲基联苯胺英文名称:3,3",5,5"-Tetramethylbenzidine英文别名:TMB;4,4"-Bi-2,6-xylidine;4,4"-Diamino-3,3",5,5"-tetramethylbiphenylCAS号:54827-17-7线性分子式:[-C6H2(CH3)2-4-NH2]2纯度:≥99.5%等级:BRMDL号:MFCD00007748Beilstein号:2808541EC号:259-364-63,3"5,5—四甲基联苯胺(简称TMB)是一种新型安全的色原试剂。与传统的色原试剂联苯胺,邻联甲苯胺及邻苯二胺等以上比较,TMB具有检测灵敏度高,稳定性好等优点,而且使用安全。经动物实验和Ames细菌自动变异性试验结果表明,TMB作为非致癌物和非致突变物。目前TMB已在逐步取代强致癌物联苯胺和其他致癌性的联苯胺衍生物,应用于临床化验,法医检测,刑事侦破及环境检测等领域。尤其是在临床生化检验方面,TMB作为过氧化酶的新底物,在酶免疫公析法(EIA)和酶联免疫吸附检验法(ELISA)获得了广泛应用。  TMB主要应用项目如下:  1、 尿联试纸的配制 2、 肝炎病毒的检测  3、 妊娠检测试验 4、 血液和尿液中葡萄糖、血红蛋白、白蛋白的快速测定  5、 粪便隐血试验 6、 血液中粒细胞值的检测  7、 类固醇、性激素的检测 8、 酶活性的测定  9、 抗原、抗体及遗传物质的分析、检测  10、 唾液中酒精的快速测定  11、 生物样品的染色  12、 水质检测、指纹呈现检测13、艾滋病毒的检测14、ELISA试剂盒底物
2023-08-19 17:41:241

轴承TMB(6209.2RS)具体什么意思??

tmb 表示为天马制造 6209表示深沟球轴承内径45mm 2RS表示带两个非接触式的橡胶密封。
2023-08-19 17:41:342

侠盗猎车:圣安地列斯中的TMB是什么键

听电话
2023-08-19 17:41:435

TMB显色液 为何要避光显色

光氧化,会使失效
2023-08-19 17:42:091

圣安地列斯 TMB 是那个键

我推测是你记错了,游戏里按键有LMB(鼠标左键)、RMB(鼠标右键)、MMB(鼠标中键)没有TMB,你自己看看了。本人不是纸上谈兵,这是我的游戏截图,谢绝引用
2023-08-19 17:42:181

TMB徒步绕勃朗峰TMB徒步路线基本介绍

勃朗峰环线是阿尔卑斯山的经典路线。一次徒步穿越三个国家,在登山运动的发源地环绕西欧最高峰。1767年,瑞士科学家贺拉斯-贝内迪克特德索绪尔首次环绕勃朗峰,为登顶绘制了路线。但是他被打败了。1786年,雅克巴尔马特和米歇尔加布里埃尔帕卡德首次征服了勃朗峰。但对很多人来说,德索绪尔的《走在山脚下》听起来更吸引人。这样,不仅是专业登山者,徒步旅行者也可以欣赏到所有壮丽的景色,如山峰阴影下的山谷、村庄、冰川和草甸。TMB周边勃朗峰徒步线路基本情况英文名:tour du mont balnc地理位置:穿越法国、瑞士和意大利的边境。最佳徒步时间:6-9月里程:170公里难度:整体爬升和下降高度范围超过10000米。在这条路上,没有冰可以爬,没有河可以涉,没有岩壁可以爬。这是一条相当简单的路线。
2023-08-19 17:42:251

hrp与tmb反应原理

TMB显色液与HRP显色雷根生物3,3",5,5"-四甲基联苯胺(TMB)是非常优越的酶免试验显色剂,能溶解于多种有机溶剂和双蒸水中。
2023-08-19 17:42:331

tmb是什么意思

tmb是什么意思介绍如下:3,4,5-三甲氧基苯甲醛(TMB)是一种重要的医药中间体,在医药工业上主要用于磺胺增效剂甲氧苄氨嘧啶(TMP)、镇咳祛痰药喘速宁、抗癫痫药3,4,5-三甲氧基肉桂酰异丙胺以及辅酶Q10的主环原料。我国的3,4,5-三甲氧基苯甲醛(TMB)的生产主要是为甲氧基苄嘧啶的配套而发展起来的。多年来,我国甲氧苄氨嘧啶除满足国内需要外还一直出口国外。但是由于受原料资源限制,布点太多,规模太小,一直是我国TMB和TMP行业发展的畸形现象。我国目前TMB的总生产能力在2500吨/年,而实际产量1400吨。中国加入WTO后,我国的TMB产业要面对着国内和国际两个市场的挑战,因此,21世纪前5年我国TMB产业应全面提升产品的竞争能力。目前国内的TMB合成技术还不够完善,尽管近几年国内科研机构在这方面做了不懈的努力,而且取得了许多可喜的成果,但是在工业生产过程中还存在不少的难题,国内大专院校、科研机构应该加强联合,相互取长补短,共同提高我国的TMB产业技术水平。
2023-08-19 17:43:131

tmb分子量

四甲基联苯胺是一种化学物质,化学式是C16H20N2。中文名四甲基联苯胺英文名Tetramethylbenzidine别称3,3",5,5"-四甲基联苯胺化学式C16H20N2简介英文名称:Tetramethylbenzidine中文名称:3,3",5,5"-四甲基联苯胺中文同义词:TMB溶液;TMB游离酸;四甲基联苯二胺;TMB游离酸溶液;钡硫氰酸盐三水合物;四甲基联苯胺,TMB;A B双液 TMB显色液;四甲基联苯胺盐酸盐 二水;3,3",5,5"-四甲基联苯胺;3,3,5,5-四甲基联苯胺溶液CBNumber:CB6682185分子式:C16H20N2分子量:240.34收起特性物理性质熔点 : 168-171 °C(lit.)沸点 : 168-171 °C密度 : 1TMB的反应产物为深蓝色,利于光镜观察,且反应产物越聚越大,常超出单个细胞器的范围(而DAB则被限制在其内),故TMB反应的检测阈较低。由于上述优点,目前TMB常用于光镜及超微结构水平的HRP及HRP-WGA神经投射的研究。需要注意的是:TMB显色液中的A液和B液应在2h内新鲜配制。另外,TMB是一种较强的皮肤刺激剂,并有致癌的潜在可能,故使用时应带手套及在通风条件下操作。TMB经HRP作用后共产物显蓝色,目视对比鲜明。TMB性质较稳定,可配成溶液试剂,只需与H2O2溶液混和即成应用液,可直接作底物使用。另外,TMB又有无致癌性等优点,因此在ELISA中应用日趋广泛。酶反应用HCL或H2SO4终止后,TMB产物由蓝色呈黄色,可在比色计中定量,最适吸收波长为450nm。ABTS虽不如OPD和TMB敏感,但空白值极低,也为一些试剂盒所采用
2023-08-19 17:43:371

生物技术上 tmb是什么意思

3,4,5-三甲氧基苯甲醛(TMB)我国的3,4,5-三甲氧基苯甲醛(TMB)的生产主要是为甲氧基苄嘧啶的配套而发展起来的。多年来,我国甲氧苄氨嘧啶除满足国内需要外还一直出口国外。但是由于受原料资源限制,布点太多,规模太小,一直是我国TMB和TMP行业发展的畸形现象。我国目前TMB的总生产能力在2500吨/年,而实际产量1400吨。中国加入WTO后,我国的TMB产业要面对着国内和国际两个市场的挑战,因此,21世纪前5年我国TMB产业应全面提升产品的竞争能力。 第一,加快产业技术进步。目前国内的TMB合成技术还不够完善,尽管近几年国内科研机构在这方面做了不懈的努力,而且取得了许多可喜的成果,但是在工业生产过程中还存在不少的难题,国内大专院校、科研机构应该加强联合,相互取长补短,共同提高我国的TMB产业技术水平。笔者认为应该加大对甲苯酚改良工艺的工业化进程,同时要对香兰醛工艺路线进行深入研究,充分发挥国内的原料优势,从而提高我国的TMB技术在国际上的竞争力。 第二,加大下游产品开发力度,寻求新的用途。TMB作为一种重要的有机中间体具有许多工业用途,它的下游产品的应用开发这几年发展也很快,但我国目前对于TMB及其下游产品用途的开发力度不够。如它的下游产品TMP,由于TMP特殊的药理作用,特别是它和其它一些抗生素配伍能大幅提高抗菌作用,国内外医药界正在进行深入研究,一些新的复方制剂不断出现。国内企业应密切关注这方面的研究进展,注意信息的收集,加强开发研究,向市场推出更多更好的复方制剂。另外如辅酶Q10,这个产品一直是国内外密切关注的产品,该产品的市场发展很快,而且利润丰厚,应该引起国内企业和科研机构的重视。因此笔者认为国内大专院校、科研机构应该加强对TMB及其下游产品的开发力度,拓宽其下游产品用途,从而促进国内TMB产业的发展。 第三,既要大力发展,又要防止出现能力和产量过剩的局面。目前我国TMB市场还有一定的缺口,而我国溴素和对甲苯酚的生产能力都比较大;另外香兰醛工艺的主要原料香兰醛在我国也已经供过于求;因此国内有原料优势的地区应该大力发展TMB的生产,可以考虑采用国外的先进技术或采用国内自行开发的技术建设新的生产装置,新建装置的生产规模以200吨/年以上为宜。这样不但可以解决溴素的销售和贮存问题,而且可以促进国内TMB工业的快速发展。 但是应该看到由于TMB潜在的市场前景和较大的利润空间,近几年国内已经开发和准备开发TMB的企业不少,防止出现TMB生产能力和产量过剩的局面。 第四,进行行业改组,实行大集团、大公司战略。我国现有的TMB生产厂家多,生产能力小,不能适应市场经济体制的要求,也不利于参加国际竞争,必须进行行业改组。目前,我国TMB企业平均生产能力不到300吨/年。生产能力小影响规模效益,影响参与国际竞争的能力。进行行业改组,从而形成几个具有国际竞争能力的生产能力大的生产企业。 第五,继续增加出口数量。今后几年,随着工艺技术的日渐完善,我国TMB市场将逐渐供大于求。因此不断扩大TMB及其合成原料药TMP的出口是发挥TMB企业生产能力、缓解国内市场压力的重要途径。由TMB合成的TMP作为老牌抗感染药品种,有其自身的优势和特色,预计未来在国际市场上仍有较大需求和发展空间。TMB和TMP的生产企业应眼睛向外,苦练内功,狠抓管理,改进工艺,降低成本,提高技术水平,增强市场竞争力;要加大科技投入,进行GMP改造,提高产品档次;要紧盯国际市场上的新情况、新变化,抓住契机,扩大国际市场份额。
2023-08-19 17:44:002

TMB的氧化产物有没有电化学信号

是没有的。四甲基联苯胺是一种化学物质,化学式是C16H20N2。中文名四甲基联苯胺英文名Tetramethylbenzidine别称3,3",5,5"-四甲基联苯胺化学式C16H20N2简介英文名称:Tetramethylbenzidine中文名称:3,3",5,5"-四甲基联苯胺TMB溶液,TMB游离酸,四甲基联苯二胺,TMB游离酸溶液,钡硫氰酸盐三水合物,四甲基联苯胺,TMB,AB双液TMB显色液,四甲基联苯胺盐酸盐二水,3,3",5,5"-四甲基联苯胺,3,3,5,5-四甲基联苯胺溶液。
2023-08-19 17:44:071

TMB是什么格式?

下载一个视频转化器,就可以转换你想要的格式了。
2023-08-19 17:44:185

酶联免疫诊断试剂盒的底物A和B分别什么作用?

与相关酶催化反应有关.酶催化底物形成产物,底物种类可以是一种也可以是多种.底物A和B分别代表了两种反应底物.
2023-08-19 17:44:372

四甲基联苯胺的应用

TMB的反应产物为深蓝色,利于光镜观察,且反应产物越聚越大,常超出单个细胞器的范围(而DAB则被限制在其内),故TMB反应的检测阈较低。由于上述优点,目前TMB常用于光镜及超微结构水平的HRP及HRP-WGA神经投射的研究。需要注意的是:TMB显色液中的A液和B液应在2h内新鲜配制。另外,TMB是一种较强的皮肤刺激剂,并有致癌的潜在可能,故使用时应带手套及在通风条件下操作。TMB经HRP作用后共产物显蓝色,目视对比鲜明。TMB性质较稳定,可配成溶液试剂,只需与H2O2溶液混和即成应用液,可直接作底物使用。另外,TMB又有无致癌性等优点,因此在ELISA中应用日趋广泛。酶反应用HCL或H2SO4终止后,TMB产物由蓝色呈黄色,可在比色计中定量,最适吸收波长为450nm。ABTS虽不如OPD和TMB敏感,但空白值极低,也为一些试剂盒所采用
2023-08-19 17:44:441

tmb和辣根过氧化物酶反应识为什么加入双氧水

TMB和过氧化氢在辣根过氧化物酶(HRP)的催化下形成oxTMB,是蓝色
2023-08-19 17:45:002

四甲基联苯胺(TMB)在ELISA测定中是何种标记酶的底物

【答案】:A邻苯二胺、四甲基联苯胺在ELISA中常作为HRP的底物;硝基苯磷脂常常作为AP的底物。
2023-08-19 17:45:091

突破免疫治疗精准盲区 FFPE检体测TMB立大功

双抗贺尔蒙疗法治乳癌 副作用少助生活品质提升感冒病毒可杀死膀胱癌?科学家:已确认无副作用癌症37年夺下10大死因榜首 肺癌最凶残T细胞淋巴癌健保新药 在台研究成果佳 免疫治疗与标靶新药百花齐放,许多癌症患者略过自费的基因诊断步骤,却又苦于成效不彰;其实只要从FFPE肿瘤检体取得完整癌细胞基因资讯,再难治的癌症,都有机会找对药治疗。 奇美医院病理中心部长李健逢与台湾基因检测公司行动基因合作,大规模的利用「广泛型基因检测」以次世代定序(NGS)分析来自各癌别的407件FFPE肿瘤检体,获得多种抗药性以及影响免疫疗法的基因突变资讯,建立起台湾首见的大型NGS本土资料库,可造福需新药试验的患者。李健逢医师指出,这证实了FFPE肿瘤检体能作为医院常规基因检测,且透过精密的基因分析,有助患者聪明分配整体疗程的医药费。 FFPE 检体具诊断优势 美国 NCCN 指南推至第一线 李健逢医师说明,FFPE将取出的肿瘤组织样本,经福马林固定制成石蜡包埋检体,让病理医师削片染色诊断病情,是常规病理报告最常用的检体,并有利保存进行研究。 针对FFPE和血液检体的差异,他解释,以FFPE检体进行分析,更能直接从病变组织上找出问题来源,抽血检测血中的循环肿瘤DNA(ctDNA),则成为无法取得组织切片者的选择,但仍有30%患者其ctDNA未在被癌细胞释出到血液时被测得;美国NCCN肺癌肿瘤治疗指引也建议,第一线治疗以检测FFPE检体为主,不建议以血液切片取代。 癌症突变特性一览无遗 从 FFPE 测 TMB 更助免疫治疗 FFPE在检测前所需的优化作业有一定难度,而医院多缺乏相关资源,因此对FFPE检体是否能符合多基因检测需求仍存疑。对此,李健逢医师与台湾基因检测公司行动基因合作,透过其具95%成功率的检体优化技术,成功提升FFPE检体中肿瘤细胞的比例,并利用「广泛型基因检测」以NGS分析407件FFPE检体,发现台湾各类癌症患者除带有多种抗药性突变,更有与免疫治疗相关的常见突变和特殊突变,证实优化后的FFPE检体可成为癌症多基因检测的首选。 针对患者是否适合免疫治疗,李健逢医师指出,目前强调肿瘤的PD-L1/PD-1或CTLA-4表现量高,是为确认肿瘤有借由该机转躲避免疫细胞辨认的工具,并以单株抗体抑制PD-L1/PD-1等抗原,阻断肿瘤细胞逃脱免疫辨识的机会,但单独PD-L1/PD-1并非可靠因子,「有些并未表现出PD-L1/PD-1的患者,治疗仍有效;有些表现出来的患者,治疗却无效。」形成免疫治疗在精准度上的盲区。 「要能从免疫治疗获益,关键在于阻断肿瘤细胞逃脱免疫辨识的机会后,免疫细胞能否认出癌细胞,进而将之消灭。」他强调,若癌细胞突变产生可被免疫系统辨识的抗原(neoantigen)越多,被免疫细胞认出的机率越高。近来研究显示,代表肿瘤有多少抗原突变的「肿瘤突变负荷量」(tumor mutational burden, TMB)成为免疫治疗的关键指标,将PD-L1/PD-1和TMB共同评估的精准度更佳,若两指数都很高,免疫治疗可更有成效。 特定癌别 TMB 在台湾与国外大不同 谁适合免疫治疗更需检测 本次研究发现,与纪念斯隆—凯特琳癌症中心(MSKCC)、美国癌症基因体图谱计画TCGA等资料库比较,台湾肺癌的TMB平均较低,另外台湾食道癌以鳞状上皮细胞癌为主,与美国较常见腺癌不同,其TMB也较低。其他种类癌症也存在细微但无法忽略的差异。李健逢医师说,这可能可以解释为何台湾和国外相同癌症的免疫治疗效果不同。 在407个检体中,也发现家族性遗传乳癌病患,可能会将致癌基因遗传给小孩,因此可先进行遗传筛检提早预防。另外,也有神经内分泌瘤复发的患者,发现其TMB高,进行免疫治疗后,无法切除的肿瘤都消失了。 李健逢医师提到,这次透过「广泛型基因分析」的407个案例分布各类型肿瘤,未来须针对特定癌症含括更多样本,并公开给各药厂,为台湾患者争取新药试验的机会。 图片来源撷取自freepik 本文授权转载自健康医疗网 话题: FFPE, 免疫治疗, 基因检测, 奇美医院, 李健逢, 癌症
2023-08-19 17:45:281

.TMB是什么格式的文件啊

Timbuktu Pro连接文档 Tmx Editor用户文档 复读学习机的专用格式 将音乐后面的扩展名改成rm或mp3再用暴风播放就可以了
2023-08-19 17:45:362

ELISA TMB显色液怎么配制?我配的怎么一混合就浑浊了

配方一:底物显色A液:醋酸钠13.6g ,柠檬酸1.6g,30%双氧水0.3ml,蒸馏水加至500ml.底物显色B液 :乙二胺四乙酸二钠0.2g,柠檬酸0.95g,甘油 50ml,取0.15g TMB溶于3mlDMSO中,蒸馏水加至500ml.使用的时候根据需要量取等量AB液混匀后使用配方二:底物缓冲液(pH 5.0磷酸钠柠檬酸):0.2 mol/L Na2HPO425.7 ml,0.1 mol/L柠檬酸24.3 mL,50mL蒸馏水TMB(四甲基联苯胺)使用液:0.5 ml 2 mg/mL TMB无水乙醇溶液,10 mL底物缓冲液,32μL30% H2O2混合,现用现配。将底物缓冲液与TMB使用液按1:1混匀即可,现用现配。
2023-08-19 17:45:461

做ELISA时要用到TMB显色液,怎么配制?效果怎么样?有人试过没有?

额!培植物不知道!不过效果还不错!
2023-08-19 17:45:573

TMB.2HCI怎么溶解

没学过
2023-08-19 17:46:072