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蓝白斑筛选过程中,T载体:DNA=1:4,DNA为PCR纯化产物,连接条件4度过夜过更长,643bp的没出现假阳性

2023-08-23 18:53:19
TAG: cr bp dn pcr
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snjk

--蓝白斑筛选过程中,T载体:DNA=1:4,DNA为PCR纯化产物,--如果是摩尔比没什么问题。其实只要目的片段摩尔数高于载体就会有很好的结果。但是如果产物量太大,则会有不良的效果。

根据你的问题

1:检测纯化产物。出了问题后纯化产物一定要走电泳查看,确认回收效率。

2:连接的产物量不用太大。3000bp的T载体如果用25ng,你的643bp产物用10~30ng足够了,这个量在凝胶上只是明确的条带而已,不会很亮。

3:检测感受态:感受态细胞如果是自己做的,也许会有杂菌。买来的也存在一定的几率。做一个空转对照,确认感受态不会有问题。

4:休克温度:42度即可,没必要45度。45秒没问题,实际上30~90秒都可以,我一般用45秒。

5:连接:4度过夜已经足够,除非你的片段很长。

6:蓝白斑筛选:有可能淡蓝色的蓝斑是你需要的克隆,如果你的克隆浅蓝色的斑很多,更可能是这样。一般效率高的话只有少于10%的蓝斑,效率一般则可能超过半数蓝斑甚至更多。

7:生长速度:关于生长速度你的概念是错误的,数百道数千bp的插入克隆生长速度不会差太多,不可以此作为依据。即使你转纯化的质粒克隆也会不一样大小。但是有插入的克隆会略略慢一点点。

8:再确认一下载体吧。

coco

这两类片段长度上没有根本的差异,对连接影响有限。更可能的原因是你长片段纯化本身的问题。或者摩尔浓度计算有问题?

阿啵呲嘚

我觉得浓度应该影响不大,只要保证回收后有DNA就行,建议回收后跑一下胶看看,如果有条带就没问题。在就是看看平板抗性是否正确,感受态是否有问题等。还有就是我们都是16度连接过夜的,长的都很好啊,阳性比例挺高。

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2023-08-16 12:35:251

有没有高人能告诉我蓝白斑筛的步骤,原理。谢谢。 有加分

在这之前先说一下做蓝白斑筛选必备条件(1)首先定义 LacZ:B(beta,打不出来,下同)-半乳糖苷酶 LacZ":含有B-半乳糖苷酶的启动子和5‘端的编码的a肽链。 那么LacZ"是没有功能的(是指能表达没有功能的蛋白质),只有和失去正常氨基端(5"端)的B-半乳糖苷酶重新互补形成完整的B-半乳糖苷酶后才具有功能,它能将底物Xgal(5-溴-4-氯-3吲哚-B-半乳糖苷)水解,形成一种蓝色化合物,菌落呈蓝色;其靠近5‘端有多克隆位点,当插入外源目的基因后将会影响该基因的功能,导致无法形成完整功能的B-半乳糖苷酶而不能水解IPTG底物,菌落呈白色。 通俗易懂的说法就是LacZ"是左半边,失去正常氨基端(5"端)的B-半乳糖苷酶是右半边,组合在一块形成有功能的酶。(2)明白以上这点,我们再往下说。 1.一般来说,做蓝白斑,质粒载体上有LacZ" 2.Lac I,是LacZ"的抑制基因,表达的阻遏蛋白和LacZ"上的操作子区结合将会阻遏LacZ"基因的表达,当有诱导物,IPTG(异丙基-B-D-硫代半乳糖苷)与阻遏蛋白结合后,将使阻遏蛋白脱离操作子,从而使LacZ"正常表达。 3.抗药基因,如Amp,用于筛除未将载体转入了的宿主细胞,这是前提,否则鉴定是没有意义的 4.而宿主应该具备的条件是具有失去正常氨基端(5"端)的B-半乳糖苷酶的一种突变体,即前文说的右半边(3)步骤如下: 1.将目的基因插入LacZ"靠近5‘端有多克隆位点,是否成功插入有待蓝白斑筛选鉴定。 2.通过一定的方法,如CaCl2诱导法将目的基因转入宿主菌(失去正常氨基端(5"端)的B-半乳糖苷酶的一种突变体) 3.将宿主菌至于含有IPTG,Xgal,以及抗生素Amp固体培养基中培养 4.形成白色菌斑,说明目的基因插入了多克隆位点,导致LacZ"的基因功能受到影响,与失去正常氨基端(5"端)的B-半乳糖苷酶组合后不能水解Xgal,菌落呈白色。形成蓝色菌斑,说明目的基因没有成功插入多克隆位点,LacZ"功能正常,与失去正常氨基端(5"端)的B-半乳糖苷酶组合后能水解Xgal,生成蓝色化合物,菌斑呈蓝色。 5.这里不存在由于质粒未能成功转入宿主而导致的Xgal不水解形成白色菌落的可能,因为未能成功导入质粒的宿主菌将会因为缺乏Amp抗性而被杀死。
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2023-08-16 12:40:533

蓝白斑筛选的原理是什么?

利用乳糖操纵子系统。野生型埃希氏大肠菌(E.Coli)产生的β-半乳糖苷酶可以将无色化合物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)切割成半乳糖和深蓝色的物质5-溴-4-靛蓝。5-溴-4-靛蓝可使整个菌落产生蓝色变化。在经人工插入外源基因后,突变型大肠杆菌的β半乳糖苷酶基因被插入的外源基因切断,无法形成完整的β半乳糖苷酶,故不能对无色化合物X-gal进行切割,菌落呈白色。一些载体(如PUC系列质粒)带有β-半乳糖苷酶(lacZ)N端α片段的编码区,该编码区中含有多克隆位点(MCS),可用于构建重组子。这种载体适用于仅编码β-半乳糖苷酶C端ω片段的突变宿主细胞。因此,宿主和质粒编码的片段虽都没有半乳糖苷酶活性,但它们同时存在时,α片段与ω片段可通过α-互补形成具有酶活性的β-半乳糖苷酶。这样,lacZ基因在缺少近操纵基因区段的宿主细胞与带有完整近操纵基因区段的质粒之间实现了互补。由α-互补而产生的LacZ+细菌在诱导剂IPTG(异丙基硫代半乳糖苷)的作用下,在生色底物X-Gal存在时产生蓝色菌落。而当外源DNA插入到质粒的多克隆位点后,几乎不可避免地破坏α片段的编码,使得带有重组质粒的LacZ-细菌形成白色菌落。这种重组子的筛选,称为蓝白斑筛选。
2023-08-16 12:41:571

蓝白斑筛选的原理是什么

蓝白斑筛选是一种基因工程常用的细菌重组子的筛选方法。野生型大肠杆菌(E.Coli)产生的β-半乳糖苷酶可以将无色化合物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)切割成半乳糖和深蓝色的物质5-溴-4-靛蓝。5-溴-4-靛蓝可使整个菌落产生蓝色变化。在经人工插入外源基因后,突变型大肠杆菌的β半乳糖苷酶基因被插入的外源基因切断,无法形成完整的β半乳糖苷酶,故不能对无色化合物X-gal进行切割,菌落呈白色。蓝白斑筛选是重组子筛选的一种方法,是根据载体的遗传特征筛选重组子,主要为α-互补与抗生素基因。蓝白斑筛选在指示培养基上,未转化质粒的菌落因无抗生素抗性而不能生长,重组质粒的菌落是白色的,非重组质粒的菌落是蓝色的,以颜色不同为依据直接筛选重组克隆的方法。一些载体(如PUC系列质粒)带有β-半乳糖苷酶(lacZ)N端α片段的编码区,该编码区中含有多克隆位点(MCS),可用于构建重组子 。这种载体适用于仅编码β-半乳糖苷酶C端ω片段的突变宿主细胞。因此,宿主和质粒编码的片段虽都没有半乳糖苷酶活性,但它们同时存在时,α片段与ω片段可通过α-互补形成具有酶活性的β-半乳糖苷酶。这样,lacZ基因在缺少近操纵基因区段的宿主细胞与带有完整近操纵基因区段的质粒之间实现了互补。由α-互补而产生的LacZ+细菌在诱导剂IPTG(异丙基硫代半乳糖苷)的作用下,在生色底物X-Gal存在时产生蓝色菌落。而当外源DNA插入到质粒的多克隆位点后,几乎不可避免地破坏α片段的编码,使得带有重组质粒的LacZ-细菌形成白色菌落。这种重组子的筛选,称为蓝白斑筛选。
2023-08-16 12:42:131

蓝白斑筛选的蓝白斑筛选原理

楼上的复制粘贴就算了吧 你说说你自己写出来的东西你自己说的明白吗?真是给组织增加困难
2023-08-16 12:42:354

蓝白斑筛选的简介

蓝白斑筛选是重组子筛选的一种方法,是根据载体的遗传特征筛选重组子,如a-互补 、抗生素基因等。蓝白斑筛选是在指示培养基上,重组质粒的菌落是白色的,非重组质粒的菌落是蓝色的,以颜色不同为依据直接筛选重组克隆的方法 。
2023-08-16 12:43:081

蓝白班筛选中,蓝色菌落还是白色菌落最可能含有重组因子,为什么

、 蓝白色斑点筛选是重组体筛选的一种方法,是根据载体的遗传特性来筛选重组体,主要包括基因互补和抗生素基因。2、 白点被屏蔽在指示介质上。未转化质粒的菌落不能生长,因为它没有抗生素抗性。重组质粒菌落为白色,非重组质粒菌落为蓝色。直接筛选重组克隆的方法是基于不同的颜色。关于简述蓝白斑筛选的原理是什么,简述蓝白斑筛选的原理的介绍到此结束,希望对大家有所帮助。
2023-08-16 12:43:222

简述蓝白斑筛选的原理。

白斑分好多种 白癜风是其中的一种 白癜风属于难治性疾病,最大特点易复发和扩散,目前治疗白癜风的药物有很多种,但是每一种药物都有一定的适应症,不一定适合所有患者,治疗不对症还会加重病情,使机体产生抗药性与耐药性,更何况白癜风发病诱因有几十种,病因病情不同选择的治疗方案也是不一样的,根据你的病情建议及时到国家正规的专业治疗白癜风的科研机构系统病因检测,查明黑色素缺失诱因,从根源入手针对性治疗,是解决白癜风的最佳途径。
2023-08-16 12:43:322

蓝白菌斑的原理是什么?

ls正解
2023-08-16 12:43:543

蓝白斑筛选的原理及其在基因克隆中的应用?

蓝白斑筛选是重组子筛选的一种方法,是根据载体的遗传特征筛选重组子,如α-互补、抗生素基因等。现在使用的许多载体都带有一个大肠杆菌的DNA的短区段,其中有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)的调控序列和前146个氨基酸的编码信息。在这个编码区中插入了一个多克隆位点(MCS),它并不破坏读框,但可使少数几个氨基酸插入到β-半乳糖苷酶的氨基端而不影响功能,这种载体适用于可编码β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主细胞。因此,宿主和质粒编码的片段虽都没有酶活性,但它们同时存在时,可形成具有酶学活性的蛋白质。这样,lacZ基因在缺少近操纵基因区段的宿主细胞与带有完整近操纵基因区段的质粒之间实现了互补,称为α-互补。由α-互补而产生的LacZ+细菌在诱导剂IPTG的作用下,在生色底物X-Gal存在时产生蓝色菌落,因而易于识别。然而,当外源DNA插入到质粒的多克隆位点后,几乎不可避免地导致无α-互补能力的氨基端片段,使得带有重组质粒的细菌形成白色菌落。这种重组子的筛选,又称为蓝白斑筛选。如用蓝白斑筛选则经连接产物转化的钙化菌平板37℃温箱倒置培养12-16hr后,有重组质粒的细菌形成白色菌落。
2023-08-16 12:44:021

在含有x-gal 和iptg 的筛选培养基上,为什么会长出蓝色菌落,和白色菌落

这个是蓝白斑筛选试验。蓝白斑筛选是重组子筛选的一种方法: 是根据载体的遗传特征筛选重组子,如α-互补、抗生素基因等。现在使用的许多载体都带有一个大肠杆菌的DNA的短区段,其中有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)的调控序列和前146个氨基酸的编码信息。在这个编码区中插入了一个多克隆位点(MCS),它并不破坏读框,但可使少数几个氨基酸插入到β-半乳糖苷酶的氨基端而不影响功能,这种载体适用于可编码β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主细胞。因此,宿主和质粒编码的片段虽都没有酶活性,但它们同时存在时,可形成具有酶学活性的蛋白质。这样,lacZ基因在缺少近操纵基因区段的宿主细胞与带有完整近操纵基因区段的质粒之间实现了互补,称为α-互补。由α-互补而产生的LacZ+细菌在诱导剂IPTG的作用下,在生色底物X-Gal存在时产生蓝色菌落,因而易于识别。然而,当外源DNA插入到质粒的多克隆位点后,几乎不可避免地导致无α-互补能力的氨基端片段,使得带有重组质粒的细菌形成白色菌落。这种重组子的筛选,又称为蓝白斑筛选。如用蓝白斑筛选则经连接产物转化的钙化菌平板37℃温箱倒置培养12-16hr后,有重组质粒的细菌形成白色菌落。
2023-08-16 12:44:121

蓝白斑筛选的介绍

蓝白斑筛选是一种基因工程常用的细菌重组质粒的筛选方法。野生型大肠杆菌(E.Coli)产生的β-半乳糖苷酶可以将无色化合物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)切割成半乳糖和深蓝色的物质5-溴-4-靛蓝。有色物质可以使整个培养菌落产生颜色变化,而颜色变化是鉴定和筛选的最直观有效的方法。
2023-08-16 12:44:201

蓝白斑筛选假阳性是怎么回事?

蓝白斑筛选是重组子筛选的一种方法:是根据载体的遗传特征筛选重组子,如α-互补、抗生素基因等。现在使用的许多载体都带有一个大肠杆菌的dna的短区段,其中有β-半乳糖苷酶基因(lacz)的调控序列和前146个氨基酸的编码信息。在这个编码区中插入了一个多克隆位点(mcs),它并不破坏读框,但可使少数几个氨基酸插入到β-半乳糖苷酶的氨基端而不影响功能,这种载体适用于可编码β-半乳糖苷酶c端部分序列的宿主细胞。因此,宿主和质粒编码的片段虽都没有酶活性,但它们同时存在时,可形成具有酶学活性的蛋白质。这样,lacz基因在缺少近操纵基因区段的宿主细胞与带有完整近操纵基因区段的质粒之间实现了互补,称为α-互补。由α-互补而产生的lacz+细菌在诱导剂iptg的作用下,在生色底物x-gal存在时产生蓝色菌落,因而易于识别。然而,当外源dna插入到质粒的多克隆位点后,几乎不可避免地导致无α-互补能力的氨基端片段,使得带有重组质粒的细菌形成白色菌落。这种重组子的筛选,又称为蓝白斑筛选。如用蓝白斑筛选则经连接产物转化的钙化菌平板37℃温箱倒置培养12-16hr后,有重组质粒的细菌形成白色菌落。
2023-08-16 12:44:363

蓝白斑筛选中,为什么白色菌落不一定是重组子

这个是蓝白斑筛选试验。蓝白斑筛选是重组子筛选的一种方法:是根据载体的遗传特征筛选重组子,如α-互补、抗生素基因等。现在使用的许多载体都带有一个大肠杆菌的DNA的短区段,其中有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)的调控序列和前146个氨基酸的编码信息。在这个编码区中插入了一个多克隆位点(MCS),它并不破坏读框,但可使少数几个氨基酸插入到β-半乳糖苷酶的氨基端而不影响功能,这种载体适用于可编码β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主细胞。因此,宿主和质粒编码的片段虽都没有酶活性,但它们同时存在时,可形成具有酶学活性的蛋白质。这样,lacZ基因在缺少近操纵基因区段的宿主细胞与带有完整近操纵基因区段的质粒之间实现了互补,称为α-互补。由α-互补而产生的LacZ+细菌在诱导剂IPTG的作用下,在生色底物X-Gal存在时产生蓝色菌落,因而易于识别。然而,当外源DNA插入到质粒的多克隆位点后,几乎不可避免地导致无α-互补能力的氨基端片段,使得带有重组质粒的细菌形成白色菌落。这种重组子的筛选,又称为蓝白斑筛选。如用蓝白斑筛选则经连接产物转化的钙化菌平板37℃温箱倒置培养12-16hr后,有重组质粒的细菌形成白色菌落。
2023-08-16 12:44:451

蓝白斑筛选假阳性是怎么回事?

楼上说的是假阴性吧
2023-08-16 12:44:552

如何知道样品中的目的菌株的数量多少?

提高筛选的成功率首先要注意无菌操作,不要人工引入额外的杂菌,有条件的话全程应该在超净台中进行。然后就是按照目标菌种的特性,引入一些营养缺陷,或者抗生素,进行涂板挑选。一般的菌株都会有某种抗性基因,以供加入对应的抗生素进行筛选。另外一种比较简单易用,效果十分可靠的筛选方法是蓝白斑筛选:蓝白斑筛选是重组子筛选的一种方法,是根据载体的遗传特征筛选重组子,如α-互补、抗生素基因等。现在使用的许多载体都带有一个大肠杆菌的DNA的短区段,其中有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)的调控序列和前146个氨基酸的编码信息。在这个编码区中插入了一个多克隆位点(MCS),它并不破坏读框,但可使少数几个氨基酸插入到β-半乳糖苷酶的氨基端而不影响功能,这种载体适用于可编码β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主细胞。因此,宿主和质粒编码的片段虽都没有酶活性,但它们同时存在时,可形成具有酶学活性的蛋白质。这样,lacZ基因在缺少近操纵基因区段的宿主细胞与带有完整近操纵基因区段的质粒之间实现了互补,称为α-互补。由α-互补而产生的LacZ+细菌在诱导剂IPTG的作用下,在生色底物X-Gal存在时产生蓝色菌落,因而易于识别。然而,当外源DNA插入到质粒的多克隆位点后,几乎不可避免地导致无α-互补能力的氨基端片段,使得带有重组质粒的细菌形成白色菌落。这种重组子的筛选,又称为蓝白斑筛选。如用蓝白斑筛选则经连接产物转化的菌平板37℃温箱倒置培养12-16hr后,有重组质粒的细菌形成白色菌落。------------------------------------------至于首先进行摇瓶培养,如果你的目标菌种含量不是实在太少,少到随机取来涂板的100微升中一个都没有,长不出菌落的话,没有这个必要。因为摇瓶的时候不同的细菌会产生竞争,而科研涉及到的一些特化菌株或者转化过的工程菌株生存能力不如野生细菌,往往会反而被淘汰......如果目的菌株实在太少,少到没法铺板那自然只好先用过量充足的培养基摇一下,这是没有办法的情况
2023-08-16 12:45:111

PCR检验转化子出现假阳性的原因

你挑的白斑,检测阳性,你凭什么说它是假阳性。提醒你注意一下,白斑是有插入片段的,蓝斑是空载体。
2023-08-16 12:45:192

昆虫细胞蓝白斑原理

野生型埃希氏大肠菌(E.Coli)产生的β-半乳糖苷酶可以将无色化合物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)切割成半乳糖和深蓝色的物质5-溴-4-靛蓝。5-溴-4-靛蓝可使整个菌落产生蓝色变化。在经人工插入外源基因后,突变型大肠杆菌的β半乳糖苷酶基因被插入的外源基因切断,无法形成完整的β半乳糖苷酶,故不能对无色化合物X-gal进行切割,菌落呈白色。一些载体(如PUC系列质粒)带有β-半乳糖苷酶(lacZ)N端α片段的编码区,该编码区中含有多克隆位点(MCS),可用于构建重组子。这种载体适用于仅编码β-半乳糖苷酶C端ω片段的突变宿主细胞。因此,宿主和质粒编码的片段虽都没有半乳糖苷酶活性,但它们同时存在时,α片段与ω片段可通过α-互补形成具有酶活性的β-半乳糖苷酶。这样,lacZ基因在缺少近操纵基因区段的宿主细胞与带有完整近操纵基因区段的质粒之间实现了互补。由α-互补而产生的LacZ+细菌在诱导剂IPTG(异丙基硫代半乳糖苷)的作用下,在生色底物X-Gal存在时产生蓝色菌落。而当外源DNA插入到质粒的多克隆位点后,几乎不可避免地破坏α片段的编码,使得带有重组质粒的LacZ-细菌形成白色菌落。这种重组子的筛选,称为蓝白斑筛选。
2023-08-16 12:45:401

筛选阳性克隆的方法和原理? 我需要至少两种方法和原理,两种.

最常见的就是蓝白斑筛选,详细的楼主可参考这个http://baike.baidu.com/view/161221.htm 方法很多,除蓝白斑筛选外,像 菌落PCR验证:详见http://baike.baidu.com/view/4118663.htm 从细菌里提取质粒后双酶切验证:用构建重组质粒时的两种限制性酶进行酶切,电泳,观察条带是否和重组之前,目的基因电泳时条带所处的位置一致. 测序验证:送测序公司
2023-08-16 12:45:481

蓝白斑筛选中可能出现的结果有哪几种,简要说明出现的原因

在进行蓝白斑筛选的时候,出现了两个奇怪现象:一、我的空白载体转的大肠杆菌不但出现了蓝斑而且还有白斑。二、连有目的基因的载体转的大肠杆菌出现了好多蓝色小点点,看起来不像是细菌。不知道是什么原因,我的大肠杆菌是做过氨苄对照测试的,应该没有杂菌的。
2023-08-16 12:45:581