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如何评价 Mark Knopfler 的专辑《Tracker》

2023-07-30 09:25:52
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我不懂运营

  Mark Knopfler第8张个人录音室专辑《Tracker》将于今年3月发行,期待中。

  Mark Knopfler"s eighth studio album, Tracker, will be released on March 16, 2015 (March 17 in North America). The album features 11 new songs inspired by a wide range of subjects including Beryl Bainbridge and Basil Bunting. The songs contain Mark"s usual wryly but accurately observed vignettes of real life wrapped up in a musical accompaniment of distinctive subtlety.

  Tracker will be available on CD, double vinyl, deluxe CD with four bonus tracks, and a lavish box set that will include the album on both CD and vinyl with a bonus CD featuring six extra tracks, a DVD with an exclusive short film directed by Henrik Hansen and an interview with Mark where he talks about the new record. Sleeve notes have been specially written by acclaimed US author Richard Ford and it also contains a numbered art print and six photographic prints.

  Mark said:

  “The album title ‘Tracker" arrived out of me trying to find my way over the decades. Out of me tracking time – looking at people, places and things from my past, and out of the process of tracking as in recording tracks in the studio.”

  1. Laughs and Jokes and Drinks and Smokes

  2. Basil

  3. River Towns

  4. Skydiver

  5. Mighty Man

  6. Broken Bones

  7. Long Cool Girl

  8. Lights of Taormina

  9. Silver Eagle

  10. Beryl

  11. Wherever I Go (featuring Ruth Moody)

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二、sort流程 Deepsort的前身是sort算法,sort算法的核心是卡尔曼滤波算法和匈牙利算法。 卡尔曼滤波算法作用:该算法的主要作用就是当前的一系列运动变量去预测下一时刻的运动变量,但是第一次的检测结果用来初始化卡尔曼滤波的运动变量。 匈牙利算法的作用:简单来讲就是解决分配问题,就是把一群检测框和卡尔曼预测的框做分配,让卡尔曼预测的框找到和自己最匹配的检测框,达到追踪的效果。 sort工作流程如下图所示: Detections是通过目标检测到的框框。Tracks是轨迹信息。 整个算法的工作流程如下: (1)将第一帧检测到的结果创建其对应的Tracks。将卡尔曼滤波的运动变量初始化,通过卡尔曼滤波预测其对应的框框。 (2)将该帧目标检测的框框和上一帧通过Tracks预测的框框一一进行IOU匹配,再通过IOU匹配的结果计算其代价矩阵(cost matrix,其计算方式是1-IOU)。 (3)将(2)中得到的所有的代价矩阵作为匈牙利算法的输入,得到线性的匹配的结果,这时候我们得到的结果有三种,第一种是Tracks失配(Unmatched Tracks),我们直接将失配的Tracks删除;第二种是Detections失配(Unmatched Detections),我们将这样的Detections初始化为一个新的Tracks(new Tracks);第三种是检测框和预测的框框配对成功,这说明我们前一帧和后一帧追踪成功,将其对应的Detections通过卡尔曼滤波更新其对应的Tracks变量。 (4)反复循环(2)-(3)步骤,直到视频帧结束。 三、Deepsort算法流程 由于sort算法还是比较粗糙的追踪算法,当物体发生遮挡的时候,特别容易丢失自己的ID。而Deepsort算法在sort算法的基础上增加了级联匹配(Matching Cascade)和新轨迹的确认(confirmed)。Tracks分为确认态(confirmed),和不确认态(unconfirmed),新产生的Tracks是不确认态的;不确认态的Tracks必须要和Detections连续匹配一定的次数(默认是3)才可以转化成确认态。确认态的Tracks必须和Detections连续失配一定次数(默认30次),才会被删除。 Deepsort算法的工作流程如下图所示: 整个算法的工作流程如下: (1)将第一帧次检测到的结果创建其对应的Tracks。将卡尔曼滤波的运动变量初始化,通过卡尔曼滤波预测其对应的框框。这时候的Tracks一定是unconfirmed的。 (2)将该帧目标检测的框框和第上一帧通过Tracks预测的框框一一进行IOU匹配,再通过IOU匹配的结果计算其代价矩阵(cost matrix,其计算方式是1-IOU)。 (3)将(2)中得到的所有的代价矩阵作为匈牙利算法的输入,得到线性的匹配的结果,这时候我们得到的结果有三种,第一种是Tracks失配(Unmatched Tracks),我们直接将失配的Tracks(因为这个Tracks是不确定态了,如果是确定态的话则要连续达到一定的次数(默认30次)才可以删除)删除;第二种是Detections失配(Unmatched Detections),我们将这样的Detections初始化为一个新的Tracks(new Tracks);第三种是检测框和预测的框框配对成功,这说明我们前一帧和后一帧追踪成功,将其对应的Detections通过卡尔曼滤波更新其对应的Tracks变量。 (4)反复循环(2)-(3)步骤,直到出现确认态(confirmed)的Tracks或者视频帧结束。 (5)通过卡尔曼滤波预测其确认态的Tracks和不确认态的Tracks对应的框框。将确认态的Tracks的框框和是Detections进行级联匹配(之前每次只要Tracks匹配上都会保存Detections其的外观特征和运动信息,默认保存前100帧,利用外观特征和运动信息和Detections进行级联匹配,这么做是因为确认态(confirmed)的Tracks和Detections匹配的可能性更大)。 (6)进行级联匹配后有三种可能的结果。第一种,Tracks匹配,这样的Tracks通过卡尔曼滤波更新其对应的Tracks变量。第二第三种是Detections和Tracks失配,这时将之前的不确认状态的Tracks和失配的Tracks一起和Unmatched Detections一一进行IOU匹配,再通过IOU匹配的结果计算其代价矩阵(cost matrix,其计算方式是1-IOU)。 (7)将(6)中得到的所有的代价矩阵作为匈牙利算法的输入,得到线性的匹配的结果,这时候我们得到的结果有三种,第一种是Tracks失配(Unmatched Tracks),我们直接将失配的Tracks(因为这个Tracks是不确定态了,如果是确定态的话则要连续达到一定的次数(默认30次)才可以删除)删除;第二种是Detections失配(Unmatched Detections),我们将这样的Detections初始化为一个新的Tracks(new Tracks);第三种是检测框和预测的框框配对成功,这说明我们前一帧和后一帧追踪成功,将其对应的Detections通过卡尔曼滤波更新其对应的Tracks变量。 (8)反复循环(5)-(7)步骤,直到视频帧结束。
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Love Me Tender 06. 听雨 07. 乘着爱自由的飞 08. The Water is Wide 09. 别这样我会哭 10. Last Night 11. 不愿说再见(Don"t wanna say good-bye) 1997年 白纸White Paper(福茂) TRACKS 01. 在每一秒里都想见到你 02. 不要开灯 03. 爱在思念蔓延时 04. 认真 05. 放逐思念 06. 白纸 07. 给我你的手 08. Dream Again 09. 想家 10. 四月还会下雪 1998年 我用生命爱你I Want to Spend My Life Time Loving You(新力)TRACKS 01. 我用生命爱你 1998年 公转自转 Revolution(新力) TRACKS 01. 公转自转 02. 梦想被冷冻 03. 爱你等于爱自己 04. One of these days 05. 我的情歌 06. 信任 07. 不管怎样 08. 2000年 09. 你以为我是谁 10. Please come back to me 2000年 永远的第一天 Forever"s First Day(新力) TRACKS 01. Introduction (序曲) 02. 永远的第一天 03. 爱在思念蔓延时 04. 龙的传人 05. 不要害怕 06. 狂想世界 07. 伤口是爱的笔记 08. 欢喜城 09. 忘了时间忘了我 10. 这就是爱 11. 你可以告诉我(你还爱谁) 2001年 王力宏创世纪影音全纪录 LeeHom Music Century(新力) TRACKS 01. Take Your Time 02. 爱我的歌 03. 每天爱你廿四小时(粤语) 04. 每天爱你廿四小时 05. Take Your Time 06. 公转自转 07. 爱你等于爱自己 08. 信任 09. 不可能错过你 10. 流泪手心 11. Julia 12. 永远的第一天 13. 龙的传人 14. 不要害怕 2001年 唯一 The One and Only(新力) TRACKS 01. 唯一 02. 爱的就是你 03. 谢绝推销你的爱 04. 安全感 05. 戒不了你 06. 不必问别人 07. 白狐狸 08. 变坏 09. If You Knew 10. 我要 11. 爱的就是你 (浪漫版 2002年 95-02 新歌+精选《王力宏的音乐进化论>95-02Evolution(新力) TRACKS DISK A A01. W-H-Y A02. Julia A03. 公转自转 A04. 唯一 A05. 不要害怕 A06. 不可能错过你 A07. 爱你等于爱自己 A08. 如果你听见我的歌 A09. Take Your Time A10. 爱的就是你 A11. Light Of My Life A12. 我用生命爱你 A13. LAST NIGHT DISK B B01. 两个人不等于我们 B02. 每一秒里都想见到你 B03. 流泪手心 B04. 白纸 B05. 永远的第一天 B06. 情敌贝多芬 B07. 好想你 B08. 雪人 B09. NATURE B10. China White B11. Happiness×3 Loneliness×3 B12. Like A Gunshot B13. 龙的传人 2003年 唯一(单曲) Last Night(新力) TRACKS 01. 唯一(中文版) 02. Last Night 03. 唯一(日文版) 2003年 唯一(专辑) The Only One(新力) TRACKS 01. 唯一 02. Last Night 03. Like A Gunshot 04. 流泪手心 05. Light Of My Life 06. China White 07. 不要害怕 08. 爱的就是你 09. Mary Says 10. Julia 11. 公转自转 12. 爱你等于爱自己 13. 不可能错过你 14. As Long As I Love You 15. 唯一(日文版) 2003年 爱的奇迹 miracle of love(新力) TRACKS 01. 爱的奇迹 征集歌词 02. 流泪手心(Japanese Version) 03. 二个人不等于我们(中文版) 2004年 不可思议 Unbelievable(新力) TRACKS 01. Ya Birthday 02. 你不在 03. Love Love Love 04. 女朋友 05. 此刻你心里想起谁 06. 不可思议电台 07. 你和我 08. What Was I Thinking 09. Not Your Average Thug 10. 不着地 11. Can You Feel My World 12. 爱无所不在 13. 我就喜欢 2004年 Dream Again(单曲) (新力) TRACKS 征集歌词 01. Dream Again 征集歌词 02. 不要害怕(Japanese Version 爱的奇迹 爱の奇迹 手のひらの泪 仆等になれなくて Dream Again Dream Again 不要害怕 (Japanese Version) Hear My Voice 1.I Can"t Stop Loving 2.爱的奇迹 3.This Could Be Love 4.Dream Again 5.不要害怕 (Japanese Version) 6.永远的起点 7.独角戏 8.Hear My Voice 9.两个人不等于我们 (Japanese Version) 10.飞向你不知的那片天 11.流泪手心 (Japanese Version) 12.如果你听见我的歌 心中的日月 1.开场 Intro 2.放开你的心 3.心中的日月 4.竹林深处 5.Forever Love 6.在那遥远的地方 7.一首简单的歌 8.星座 9.过来 10.爱错 11.Follow Me 盖世英雄 1.在梅边 2.花田错 3.盖世英雄 4.Kiss Goodbye 5.完美的互动 6.大城小爱 7.第一个清晨 8.哥儿们 9.让开 10.爱 因为在心中 为你而声 限定盘 1.花田错 (Remix) 2.Kiss Goodbye (演奏版) 3.爱 因为在心中 4.大城小爱
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大家小时候是否曾经有过一个梦想,就是在家里构筑一个超大的火车铁轨系统?小虎以前很喜欢玩火车玩具,常常都会把塑胶铁轨架得家里到处都是,然后启动火车头玩具,看着它四处在家里奔驰跑着,就会觉得自己也在跟着火车头跑,仿佛像是火车旅行一样。 现在Steam上面有一款游戏《Tracks-TheTrainSetGame》,可以用小时候最爱的木头火车,架构出属于自己的火车世界!里面的素材相当多样,除了火车与铁道之外,还有像是各式建筑物、栅栏、标示牌、喷水池、花草树木等等,全都可以由自己来搭配,你可以像以前小时候玩玩具一样,搭建出你心中想要的铁路系统。 ▲《Tracks-TheTrainSetGame》的游戏宣传影片,可以看到除了第三人称之外,游戏也有第一人称视点的影片。让玩家过足自架火车系统的瘾。 ▲在自己的家中布满火车轨道!这不就是许多大孩子们小时候最想完成的梦想吗? ▲游戏中有许多物件都可以使用,包括建筑物、栅栏、轨道等等,玩家可以自己随意搭配。 ▲游戏中也有一些任务,必须要玩家考虑到乘客的使用率和载客量等等周边规划,善用巧思构筑出一个让大众都喜爱的运输系统吧! 游戏目前才刚上架,价格只要不到新台币300元,有兴趣的朋友可以上Steam瞧瞧喔!
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The word tracks in Paragraph 9 is closest in meaning to______.A.waysB.music

【答案】:B本题属于词汇题,主要考查考生根据上下文对单词track的理解。在第九段track出现的句子里紧跟该词出现了Chopin(肖邦)。因此可以推断在这里track的意思是“音乐,歌曲”,故选B,而选项A(道路)、C(田径)、D(痕迹)均不符合题意。
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track in time 及时跟踪trackn (人踩出的)小道,小径; (人、动物或车辆留下的)足迹,踪迹; 车辙; 轨道;v 跟踪; 追踪; (尤指用特殊电子设备)跟踪; 跟踪(进展情况)
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如何评价 Mark Knopfler 的专辑《Tracker》

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我在西藏自驾旅游,求推荐一个APP,是能记录行驶过得路线,可以看到每天的行程公里记录和走过的轨迹!

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2023-07-30 06:28:512

文献阅读笔记:CUT&Tag

题目: CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells 许多染色质特征在调控基因表达中起着重要作用。要完全理解基因调控,需要在小样本细胞中以高分辨率绘制特定染色质特征。在这里,我们描述了Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag),它是一种酶栓系(enzyme-tethering)策略,提供了高效的高分辨率测序文库来分析不同的染色质成分。在CUT&Tag中,染色质蛋白被一种特异性抗体原位结合,然后将蛋白A - Tn5转座酶融合蛋白栓在一起。转座子酶的激活有效地产生具有高分辨率和极低背景的片段文库。从活细胞到测序文库的所有步骤都可以在实验台上的单个管或高通量管道中的微孔中完成,并且整个过程可以在一天内完成。我们通过分析组蛋白修饰、RNA聚合酶II和转录因子在低细胞数量和单细胞上的应用,证明了CUT&Tag的用途。 大规模平行测序的出现和每个碱基成本的大幅降低推动了基因组学革命,然而,由于用于绘制染色质片段的方法存在局限性,表观基因组分析的前景一直滞后。染色质免疫沉淀测序技术(ChIP-seq)及其衍生方法具有信号低、背景高和交联导致的表位掩蔽等缺点,且需要大量的细胞。ChIP的替代方法包括对非固定细胞的酶拴系方法,如DamID7、ChEC-seq和CUT&RUN,将感兴趣的蛋白质定位在原位,然后进行全基因组分析。例如,CUT&RUN基于ChIC策略,通过连续结合特定抗体来map染色质蛋白,然后将Protein A/微球菌核酸酶(pA-MNase)融合蛋白固定在可渗透细胞(不交联)。通过添加钙激活MNase,将片段释放到上清液中,进行DNA提取、文库制备和paired-end测序。CUT&RUN提供了与ChIP-seq相比背景信号低得多的特定染色质组分的碱基对分辨率,大大降低了全基因组分析的成本。 虽然CUT&RUN只需要100-1000个细胞就可以产生高质量的数据,但它必须随后进行DNA末端修饰和adapters连接来准备测序文库,这增加了整个过程的时间、成本和工作量。此外,通过CUT&RUN方法将MNase切割后的片段释放到上清液中并不适合应用于单细胞平台。 (意思是CUT&RUN虽然很牛,但是做单细胞还是不行的) 在这里,我们克服了ChIP-seq和CUT&RUN的局限性,使用了由超活性Tn5转座酶-蛋白A (pA-Tn5)融合蛋白负载的测序adapters组成的转座体。在原位“栓系”后,激活pA-Tn5导致因子靶向标记,生成用于PCR富集和DNA测序的片段。从活细胞开始,CUT&Tag可以在一天内在实验台上或高通量方法中提供扩增的测序文库。我们证明,使用低细胞数甚至单个细胞,多种染色质成分可以在非常低的背景下被描绘出来。这种简单、低成本的方法将使表观遗传研究在生物研究的各个领域更加强大。 通过tagmentation实现染色质分析(图1a),我们用一种针对H3K27me3的抗体孵育完整的渗透的人类K562细胞,H3K27me3是一种丰富的组蛋白修饰,它标记沉默染色质区域。我们用抗兔的二抗孵育细胞,以增加染色质位点上的抗体结合局部浓度,然后用预载有测序adapters的过量pA-Tn5融合蛋白孵育细胞,在核里将酶系在抗体结合位点。转座体与暴露的DNA有内在的亲和性,因此我们在严格的条件下清洗细胞以去除未拴住的pA-Tn5。然后,我们通过添加Mg++激活转座体,整合含h3k27me3核小体spanning位点的adapters。最后,从纯化的DNA中富集片段文库,并将其汇集到Illumina HiSeq的flow cell上进行多重配paired-end测序。整个方案在一个管中操作所有步骤(图1b),其中渗透的细胞首先与抗体混合,然后固定在Concanavalin A包被的磁珠上,允许在所有连续的洗涤和试剂孵育步骤中对细胞进行处理。为了在实验之间进行标准化,我们使用来自于大肠杆菌转座子酶蛋白生产过程中提取的少量示踪基因组DNA来进行样本read counts的标准化,以代替CUT&RUN9中推荐的异体spike-in DNA。 在大约800万reads的人类基因组组装中,显示了H3K27me3标记的大染色质区域的清晰图谱(图2a)。我们还获得了H3K4me1和H3K4me2组蛋白修饰的图谱,标记了活跃的染色质位点。相比之下,用非特异性IgG抗体孵育细胞,产生非常稀疏的背景信号(图2a)。为了评估CUT&Tag的信噪比,我们将其与CUT&RUN和ChIP-seq生成的分析结果进行了比较,检测K562细胞中的H3K27me3(相同的兔单克隆抗体)。为了直接比较这三种技术,我们将每个数据集的读取深度设置为800万reads。三种方法的landscape都是相似的,但是在ChIP-seq数据集中背景噪声占主导地位(图2a),因此 ChIP-seq需要更多的reads来区分染色质特征和背景 。相比之下,CUT&RUN和CUT&Tag的背景噪声都非常低。正如预期的那样,在H1胚胎干细胞(H1 ES)不同的人类细胞类型中的同一染色质区域,观察到非常不同的profiles(图2b)。为了更定量地比较每种方法中的信号和噪声水平,我们为每种方法生成了H3K4me1修饰基因组位点的热图。对每个数据集进行800万reads进行比较,我们发现在所有位点中,组蛋白修饰的CUT&Tag比CUT&RUN显示出更高的信号(图2c)。两种方法都有较低的背景周围的站点。相比之下,ChIP-seq信号的动态范围非常狭窄,只有CUT&Tag信号范围的1/20左右,而且大多数位点的信号都非常弱。为了定量比较,我们使用在H3K4me1 ChIP-seq数据集上显示的定义的前10,000个峰附近,计算CUT&Tag、CUT&RUN和ChIP-seq数据集的平均read counts(图2g)。我们发现,CUT&Tag分析在这些位点上提供了更多的信号积累,这意味着CUT&Tag在区分染色质特征时最有效,所需的reads最少。 基因和调控元件的转录状态可以从组蛋白修饰模式进行推断,但基因表达可以通过分析染色质结合的RNA聚合酶II (RNAPII)直接读出。 我们使用了RNAPII的磷酸化抗体(S2/5p),用以区分参与的聚合酶。Landscapes显示RNAPII CUT&Tag在许多基因上的富集(图2a),启动子热图显示这种富集主要位于活性基因的5 "端(图2d)。 为了在不依赖于注释的情况下验证RNAPII CUT&Tag的结果,我们选择了通过碱基对分辨率PRO-seq技术获得的转录run-on数据,该技术使用一种与染色质分析无关的方法直接mapping RNAPII。PRO-seq定位了被激活的RNAPII 5 "末端的位置,并用于识别转录起始位点下游暂停的RNAPII。使用MACS2 call peak(RNAPII S2/5p CUT&Tag),并分析通过PRO-seq run-on人类K562细胞(SRA GSM1480327)的数据集。当使用RNAPII CUT&Tag 的MACS2评分排序时,PRO-seq的occupancy和RNAPII- ser2 /5p CUT&Tag的occupancy之间有密切的对应关系(图2e)。 通过CUT&Tag分析的H3K4me1修饰的重复非常相似,证明了该方法的可重复性(图3a)。当我们比较H3K27me3 CUT&Tag重复时,我们得到了相似的重现性。在先前的CUT&RUN分析实验中,我们发现与活性启动子和增强子相关的H3K4me2组蛋白修饰landscapes与ATAC-seq谱相似。因此,我们使用H3K4me2抗体进行CUT&Tag。我们发现H3K4me2在强的ATAC-seq峰时occupancies很高(图2f),read counts也很多(图2h),这意味着H3K4me2图谱能以更高的灵敏度捕获基因组中最占主导的染色质位点。 为了量化H3K4me2 CUT&Tag相对于H3K4me2 CUT&RUN、H3K4me2 ChIP-seq和ATACseq的敏感性,我们对每个方法进行了采样,并使用MACS2默认参数call peak。然后,我们评估在每一个peak里的reads比例。我们发现,CUT&RUN和CUT&Tag都比ChIP-seq或ATAC-seq有更多的reads,表明它们具有极低的信噪比(图3b)。此外,CUT&Tag在低测序深度时的峰分布更为迅速,其中~ 200万reads相当于CUT&RUN的100万reads(或ChIP-seq的2000万reads),证明了CUT&Tag的超高效率。在所有的方法中,只有CUT&Tag在峰内达到0.6的分数。因此,通过两种组蛋白修饰(H3K4me2和H3K27me3),我们将染色质landscape分为活性区和沉默区,即使测序深度相对较低。 为了确定我们是否可以使用CUT&Tag来绘制转录因子结合的图谱,我们测试了pA-Tn5在转录因子上的栓系是否可以与基因组中可接近的DNA位点区分开来。我们在CUT&Tag反应中使用了NPAT核因子的抗体,NPAT核因子是复制依赖组蛋白基因的转录辅激活因子。NPAT只结合了1号染色体和6号染色体组蛋白clusters中的约80个可接近位点,因此我们可以比较真正的结合位点和可接近位点。在NPAT CUT&Tag图谱中,约99%的read counts在组蛋白基因启动子处积累(图4a)。通过对已发表的ATAC-seq数据对应位点进行评分,我们发现较少数量的counts分布在K562基因组的可接近位点(图4b)。这可能是由于一些未栓系的pATn5与暴露的DNA原位结合造成的,但通过read覆盖的巨大差异,很容易区分抗体栓系位点与可接近位点(图4c)。事实上,通过标准算法进行call peak,NPAT CUT&Tag ~ 9000位点的数据生成一个列表,其中包括组蛋白基因启动子和10%的ATAC-defined可接近位点。虽然这只是定义的~ 54000可接近位点的一小部分,调整阈值和严格的NPAT peak calling可以提高峰检测。 为了测试CUT&Tag是否易于分析更丰富的转录因子结合位点,我们分析了CCCTC结合因子(CTCF)DNA结合蛋白。在这些实验中,我们通过改变缓冲液的严格程度来评估染色质中转录因子的置换情况。在低盐和中盐浓度条件下,我们观察到CUT&RUN和ChIPseq检测的CTCF位点的read计数(图5a),但有额外的小峰。这些额外的峰表明,未“栓系”pA-Tn5有助于这些实验的coverage。为了确定真正的CTCF结合位点是否可以通过read深度与可接近特征区分开,我们比较了高置信度CTCF位点(由peak-calling定义)的CUT&Tag read counts CUT&RUN data)到可接近位点的CUT&Tag read counts(由ATAC-seq数据peak-calling定义)。我们发现,这两种read counts分布重叠,但可接近位点的read counts低于CTCF位点(图5b)。仅基于reads深度,我们鉴别出约5600个CTCF结合位点,错误发现率为1%。比较这两类的motif富集,发现高信号motif对应CTCF motif(E-value = 2.1 × 10u221269),低信号motif不对应。 我们通过绘制以CTCF结合位点为中心的reads末端来评估CUT&Tag的分辨率。这表明CUT&Tag保护的“footprint”在CTCF motif跨越80 bp(图5c)。而从Tn5整合保护的片段大于CUT&RUN中MNase保护的约45 bp,这表明tethered转座酶产生了高分辨率的因子结合位点图。在300-500mM盐浓度的情况下,不同的盐浓度洗涤也能得到相似的footprints结果,在一定程度上降低了信噪比(图5c)。高分辨率的CUT&Tag提供了单个位点的结构细节。例如,在代表性位点对CTCF、H3K4me1、H3K4me2、H3K4me3和ATAC映射的叠加,揭示了可接近的DNA、CTCF结合和修饰的邻近核小体之间的关系(图5d)。 ChIP需要大量的细胞材料,限制了它在实验和临床样品中的应用。然而,我们和其他人之前已经证明,像CUT&RUN这样的tethered分析策略具有足够的敏感性,因此分析小细胞数通常是可行的。CUT&Tag的信号改进表明,这种方法可以在有限的样本下更有效地工作。我们首先用CUT&Tag在大约1500倍范围的材料中测试了H3K27me3修饰,从100,000个细胞到60个细胞。我们从所有实验中观察到非常相似的高质量染色质谱(补充图1b),表明在少量材料的情况下仍然保持高数据质量。 CUT&Tag的优点是,从抗体结合到adapters整合的整个反应都发生在完整的细胞内。转座子酶和染色质片段仍然结合在一起,因此片段化的DNA被保留在每个细胞核内。 我们开发了一种简单的策略来生成单个细胞的染色质谱,我们称之为 单细胞CUT&Tag(scCUT&Tag) (图6a)。我们对大量K562细胞群体进行H3K27me3修饰的scCUT&Tag分析,但在步骤之间温和离心,而不是ConcanavalinA 磁珠。整合后,我们使用Takara ICELL8纳米分装系统将单个细胞分离到5184孔的纳米孔芯片里,通过对芯片成像识别包含一个或仅包含一个细胞的纳米孔。然后,我们使用两个indexed引物对每个通过的纳米孔进行文库PCR富集,最后将芯片上的所有富集文库集中到一起进行Illumina深度测序,达到高冗余,以评估每个细胞的采样和覆盖。每个孔的文库由两个索引的独特组合来区分。 单个细胞染色质图谱的聚集与大量样本中产生的图谱非常匹配(图6b),具有较高的相关性(Pearson "s r = 0.89)。每个细胞通过全基因组的reads数量进行排序,每个细胞的唯一片段都显示在tracks中。值得注意的是,单个细胞中的大多数reads都位于分析中定义的H3K27me3区域内,这表明单细胞染色质分析的高恢复率(图6b)。H3K27me3 scCUT&Tag的第二个重复证明了单细胞分析的重现性。类似地,H3K4me2修饰的单细胞图谱概括了可接近和活性染色质的基因组landscapes(图6c)。在单个细胞中,相当大一部分reads属于定义的活性和沉默染色质特征(图6d, e)。 染色质特征的广度——从H3K4me2的大约5个核小体到H3K27me3区域的数百个核小体——即使在单个细胞稀疏采样的情况下,也有助于检测染色质特征。为了评估单个细胞的染色质特征是否可以用来区分细胞类型,我们进行了H3K27me3的scCUT&Tag分析(H1细胞)。我们再次发现,很大一部分reads位于分析定义的域内(图6e),bulk数据和聚集的单细胞数据之间具有很高的相关性(Pearson"s r = 0.85)。通过比较包含HoxB结构域的2Mb区域,可以发现H1细胞中单细胞轨迹中明显的组蛋白甲基化,而K562细胞中该区域缺失(图6f)。这些全基因组模式足以高效地区分H1细胞和K562细胞。因此,染色质图谱提供了一种区分单个细胞类型的方法。 通过CUT&Tag分析染色质可以有效地揭示基因组中的调控信息。与RNA-seq仅测量基因表达不同,染色质分析在识别沉默区方面具有独特的优势,这是细胞在发育过程中的确定“cell fates”的关键方面。虽然像ATAC-seq这样的方法可以绘制出可接近位点和因子结合位点,但结合在这些位点上的特定染色质蛋白必须从motif或染色质谱数据推断出来。虽然基于ChIP的方法已广泛应用于细胞系模型,但由于交联和染色质片段化的影响,ChIP-seq对染色质的分析受到限制,因为每个实验都需要优化。同样,最近的另一种交联染色质分析方法ChIL-seq比CUT&Tag需要更多的步骤,需要3-4天来完成所有步骤。相比之下, CUT&Tag过程,像CUT&RUN一样,是一种不固定的原位方法 ,并且很容易以标准化的方法实现。这与CUT&Tag的成本效益相结合,使得它适用于可以在核心设施中实现的高通量。可以想象,用户仅提供他们的细胞和抗体的混合物,并在短短几天内收到处理的深度测序文件。由于高通量CUT&Tag的第一步是在4°C条件下进行抗体孵育,样本可以在设备中积累一夜,然后一起装载到一个96孔板上进行自动化处理,就像我们之前在AutoCUT&RUN中演示的那样。由于试剂的高效使用和更好的信噪比,CUT&Tag比AutoCUT&RUN需要每个样本更少的reads,这已经比商业化外显子组测序便宜得多。虽然这种pipeline的简单和低成本很吸引人,自动染色质分析的主要优点是最小化批次效应并处理影响,从而最大限度地再现。这些方面对于临床分析和色谱靶向药物的检测是至关重要的。 我们已经证明,CUT&Tag使用ICELL8纳米分装系统提供了高质量的单细胞图谱,该系统可以在加入试剂和PCR之前进行成像。同样,CUT&Tag也应该适用于10×Genomics系统,他们最近公布了单细胞ATAC-seq方法。由于adapters是添加在bulk里的,所以CUT&Tag对高通量单细胞平台的适应性是有可能的。在CUT&Tag数据集中,低水平的非靶向可接近DNA位点和高水平的CTCF结合位点的不同分布表明,通过对这两种预期的潜在分布建模,可以在不使用其他数据的情况下区分真实结合位点和可接近DNA位点。 这种策略的一个优点是,真实结合位点和可接近特征之间的统计差异允许在同一实验中描述两个染色质特征,其中可接近DNA位点和目标因子的结合位点可以被同时注释。 在未来,我们预计adapters的条形码将允许多个表位同时在单个细胞中进行大量的分析,最大限度地发挥单细胞表观基因组分析在发育和疾病研究中的作用。 最后,放一张ChIP-seq,CUT&RUN和CUT&Tag三种方法的比较图:
2023-07-30 06:28:581

Extra Train Station Tracks 求助大神,这个mod怎么使用

这么多mod,加上后期发展越来越大,这吃配置啊。。。。这得需要什么配置才行啊。
2023-07-30 06:29:051

win的用法

win 不跟人 跟活动 who won the race?win over sb 把某人争取过来i defeat you. 我赢了你
2023-07-30 06:24:591

为什么中国式英语如此流行

中国式英语是指中国的英语学习和使用者由于受母语的干扰和影响,硬套汉语规则和习惯,在英语交际中出现的不合规范或不合英语文化习惯的畸形英语。这种英语往往对英语国家的人来说不可理解或不可接受。把“你的身体很健康”译成Your body is very healthy,在英语交际中套用汉语交际习惯使用Teacher Zhang(张老师)作为称呼语,Have you eaten up?(你吃过了吗?)作为打招呼用语。这种句式虽没有语法错误,却不合英语文化习惯,也可纳入中国式英语之列,统称之为Chinglish。中国式英语翻译一共有三种,Chinglish,Pidgin English,Canton English。Chinglish 用的多一些,指中式英语,Pidgin English 指的是洋泾浜英语,是解放前在上海洋泾浜地区流传的一种中式英语,也泛指所有中式英语。例如,上海话中的洋泾浜英语。希望我能帮助你解疑释惑。
2023-07-30 06:25:032

latex怎么样右对齐?

LaTeX 对齐方式一行对齐:leftline{左对齐} centerline{居中} ightline{右对齐}多行或者段落对齐:左对齐 egin{flushleft}...end{flushleft}居中 egin{center}...end{center}右对齐 egin{flushright}...end{flushright}
2023-07-30 06:25:051

阿房宫的来历

阿房宫是秦王朝的巨大宫殿,遗址在今西安西郊15千米的阿房村一带,始建于公元前212年。为全国重点文物保护单位。
2023-07-30 06:25:083

counterpart fund是什么意思

counterpart fund英 [u02c8kauntu0259pɑ:t fu028cnd] 美 [u02c8kau028antu025au02ccpɑrt fu028cnd] 词典对应[对等]基金,回头资金网络配套资金; 对应基金; 对等基金双语例句百度知道1We have established a pool of funds and mergers and acquisitions counterpart fund mergers and acquisitions Fund is a project risk, maximum overcome risks. 我们设立了对应的集合基金和并购基金,并购基金就是项目出现风险的时候,最大限度的克服风险。
2023-07-30 06:25:101

“中国式英语”用英语怎么说

Chinese english
2023-07-30 06:25:101

如何安装latex

  安装latex方法:   1、浏览器搜索“CTex”,找到ctex项目官网;   2、进入官网界面;   3、找到最新版本,然后点击下载;   4、点击安装文件进行软件安装;   5、选择恰当的安装目录;   6、安装进行中;   7、安装完成后,打开WinEdt就可以使用LaTex。
2023-07-30 06:25:121

win键是什么意思?

win键是ctrl键和alt键之间的按键。windows键就是电脑键盘上ctrl键和alt键之间的按键。它带着微软的徽标,跟开始菜单一样的图标,它属于辅助按键,主要与其它按键组合使用,实现一些特定的功能,组合成多种快捷操作方式。比如Win+1可以打开任务栏左下角第一个应用,Win+R可以打开运行符,Win+Q可以打开微软小娜Cortana。win键的使用方法:1.最大化窗口徽标键+↑(上方向键)使当前使用中的窗口最大化,和将窗口用鼠标拖拽到屏幕上缘的效果一样。2.缩小窗口徽标键+↓(下方向键)使当前使用中的最大化窗口正常显示。3.窗口贴向左右侧徽标键+←/→(左/右方向键)使当前使用中的窗口贴向屏幕左/右侧,占用50%显示器的面积,和将窗口用鼠标拖拽到左/右边缘效果一样。4.跨显示器左右移动窗口徽标键+shift+←/→(左/右方向键)很多用户都会有2个显示器进行分屏,当使用双显示器时,并设置为"扩展桌面"时,使用这个快捷键可以使当前窗口移至左/右侧显示器显示。
2023-07-30 06:25:131

连词成句英语

1Can I go with you?2What are you doing there?3We mustnot pick flowers in the park4Is it an oak tree?5I thing they are violets
2023-07-30 06:25:142

如何分辨“中国式英语”?从哪些特点可以分辨?是不是“直译”就是属于“中国式英语”?

这是一个绝对不值得研究的题目!有识还是无识不是自己吹牛的,别人判断好了!思考非常简单:只有2个语言,汉语及英语。那么,听了英语读了英文之后,嘴里笔下能出来什么呢?只有三个东西。一个叫作正确的好的英语英文,这样说是因为文、语不同。一个叫作正确的好的汉语中文。最后一个叫作不是人语,也不是人文!或者干脆叫作不是人话!这个不是人话的,就包括“中国式英语”,“汉化的英文”了。
2023-07-30 06:24:552

惊喜用英语怎么说?

惊喜的英文:surprise。英式 发音[su0259u02c8prau026az],美式发音 [su0259ru02c8prau026az] 。名词:不寻常的事件,意外之事;惊奇,惊讶;令某人意外惊喜的事物(如礼物、旅行等);出其不意(出人意料)的方法。例句:Sue"s face lit up with surprise.苏的脸上露出惊讶的表情。动词:使(某人)吃惊;意外发现,当场抓获,突然袭击;给……惊喜,使喜出望外。例句:The news really surprised me.这消息真让我吃惊。感叹词:感到惊奇吧!Surprise! Happy Birthday!惊喜吧!生日快乐!形容词:令人惊奇的,意外的。Unbeknown to her they had organized a surprise party.他们瞒着她筹备了一个给她惊喜的聚会。
2023-07-30 06:24:492

惊喜的英文怎么写

1、惊喜的英文为:surprise。2、作名词时,意思有:意想不到(或突然)的事;令人惊奇的事(或消息等);惊奇;惊讶;意外;出人意表的做事方式;出奇制胜的策略。3、示例:Ihaveasurpriseforyou:WearemovingtoSwitzerland!4、我有一个惊喜的消息要告诉你:我们要搬去瑞士了!5、作动词时,意思有:使惊奇;使诧异;使感到意外;出其不意地攻击;使措手不及;无意中发现。6、示例:Wellsolvethecaseourselvesandsurpriseeveryone.7、我们要自己解决这件事,然后让所有人感到吃惊。
2023-07-30 06:24:411

中国式英语的纠正策略

产生中国式英语的原因多种多样,但最根本的原因是英汉语义上的误解和句法结构的误用。由于英语学习者在英语语言知识方面的有限性,错误地认为汉语和英语的各种因素都是相同的,只要把自己掌握的汉语各种表达方式转换成英语的词语就可以了。中英文化的差异值得学生们注意学习领会。中国的学生学英语,受母语影响而出现中国式英语并不奇怪,而是学习英语过程中出现的正常现象,而这也正是他们从不会英语到掌握英语的必经阶段。那么,如何很快缩短这个过程并能熟练而正确地运用英语呢?我们认为可以从以下几方面入手纠正中国式英语。 语言是交际工具,学习英语的目的是学习者掌握知识和基本技能并能运用英语进行交际。掌握基础知识和基本技能不容易,但正确地使用英语进行交际就显得更加困难。因为我国英语教学是在非自然的外语情境中进行的,学生学习英语时受母语及中国文化的影响很重。因此,正确使用英语进行交际不仅要以语言知识和技能为基础,还要了解所学语言国家的社会文化、风土人情、生活习惯、交际的场合和对象的具体身份、社会和心理因素等。为了克服或满足上述要求,就必须培养学生的用语能力。在语言教学中应给学生创设情境,进行模仿对话,培养学生正确、流利的表达能力和语感能力。此外,还要培养学生课外阅读的兴趣。通过阅读了解英语国家的社会、文化、历史、地理乃至人情风俗等方面的知识,以便深入理解其文化的内涵意义,真正认识并掌握英语自身的语言规律及其表达习惯,从而避免中国式英语的发生。中国式英语现象是学生学习英语中必然经历的一个过渡期。在英语教学实践中,关键问题是如何缩短这一过渡期。教师可针对性地采用两手抓的方法,缩短这一过渡期。一是贯彻文化背景教学原则,进行中西方文化对比教育,培养学生的文化洞察力,加强学生对语言的社会文化含义了解,加深学生对语言本身的认识,正确理解和准确运用所学语言,提高其跨文化交际能力;二是对这些中国式英语错误有一个较为科学的全面分析,与学生的“自创规则”相联系,了解学生学习过程中的心理特点和阶段性,对症下药,帮助学生加快“自我审视”的步伐,缩短这一本族语向目的语的过渡期。
2023-07-30 06:24:411

latex如何插入图片

要用到 graphicx 包:在导言区加上一行 usepackage{graphicx}.还要有制作 EPS 图片的软件。假设图片文件是 figurefile.eps在正文中需要图片的地方,只要像这样即可:一张图片:egin{figure}[!hbt] centering includegraphics[width = 30 mm, height = 30 mm]{figurefile.eps} caption{图示说明} label{fig:id} % 用于交叉引用end{figure}如果是多个图片,可以在 figure 环境中使用 tabular 环境。例如 6 张图片分三行:egin{figure}[!hbt] centering egin{tabular}{cc} includegraphics[width = 30 mm, height = 20 mm]{figure11.eps} & includegraphics[width = 30 mm, height = 20 mm]{figure12.eps} \ (a) 图片 11 的简介 & (b) 图片 12 的简介 \ includegraphics[width = 30 mm, height = 20 mm]{figure21.eps} & includegraphics[width = 30 mm, height = 20 mm]{figure22.eps} \ (c) 图片 21 的简介 & (d) 图片 22 的简介 \ includegraphics[width = 30 mm, height = 20 mm]{figure31.eps} & includegraphics[width = 30 mm, height = 20 mm]{figure32.eps} \ (e) 图片 31 的简介 & (f) 图片 32 的简介 end{tabular} caption{图示说明} label{fig:id} % 用于交叉引用end{figure}
2023-07-30 06:24:382

求动画片《爆蛋晶英》里所有的插曲,好好听,有英文、中文的!

Flower - Cody Simpson I know I"ll never be the apple of your eye我知道我永远不能成为你的心肝宝贝 But I pick you a flower if you like但如果你愿意,我会送你鲜花 I know I"ll never be the stars up in your sky我知道我永远不能成为你头顶的繁星 But I"ll pick you a flower if you like但如果你愿意,我会送你鲜花 She loves me, she loves me not她爱我,她不爱我 She says she loves me 她说她爱我, has she forgotten that she loves me她忘了她爱我吗 Love me one more time再爱我一次 I know I"ll never be the apple of your eye我知道我永远不能成为你的心肝宝贝 But I can pick you a flower if you like但如果你愿意,我会送你鲜花 "Cause I meet you down by the end of the road因为我会在路的尽头与你相遇 Where the sunset glows and the garden grows落日散着余晖,鲜花静静生长 I got one pair of shoes with 20 holes in the toes我穿着一双破洞鞋 And I would walk 20 miles 长途跋涉, just to get to those blue eyes只为看见那双蓝色眼眸 If you will smile for me to my surprise如果你能对我微笑 I would stay for a while to see what comes next我愿留下来,期盼更多 Or we could take off our clothes and have 也许我们可以宽衣解带, long conversations in french甜言蜜语 I know I"ll never be the apple of your eye我知道我永远不能成为你的心肝宝贝 But I"ll pick you a flower if you like但如果你愿意,我会送你鲜花 I know I"ll never be the stars up in your sky oh no我知道我永远不能成为你头顶的繁星,哦,不 But I"ll pick you a flower if you like但如果你愿意,我会送你鲜花 And she loves me, she loves me not她爱我,她不爱我 She says she loves me has she forgotten她说她爱我 她忘了她爱我吗 That she loves me她爱我 Love me one more time再爱我一次 I know I"ll never be the apple of your eye我知道我永远不能成为你的心肝宝贝 But I pick you a flower if you like但如果你愿意,我会送你鲜花 Let"s go来吧 Roses are red, violets are blue红色玫瑰,蓝色紫罗兰 But it is true I"d be through 千真万确 if I don"t have you没有你我活不下去, So I just chill up on the hill picking daffodils我为你上山采摘水仙 Making wishes, about you mrs紧张地许下关于你的愿望 "Cause I know I"ll never be the apple of your eye因为我知道我永远不能成为你的心肝宝贝 But I"ll pick you a flower但我会送你鲜花
2023-07-30 06:24:341

isdn的中文全称是什么?

综合业务数字网(Integrated Services Digital Network,ISDN)。是一个数字电话网络国际标准,是一种典型的电路交换网络系统(circuit-switching network)。它通过普通的铜缆以更高的速率和质量传输语音和数据。ISDN是欧洲普及的电话网络形式。GSM移动电话标准也可以基于ISDN传输数据。因为ISDN是全部数字化的电路(只有0和1这两种状态),所以它能够提供稳定的数据服务和连接速度,不像模拟线路那样对干扰比较明显。在数字线路上更容易开展更多的模拟线路无法或者比较困难保证质量的数字信息业务。除了基本的打电话功能之外,ISDN还能提供视频、视频会议、图像、传真、远距教学、个人电脑通信与数据服务。ISDN需要一条全数字化的网络用来承载数字信号,故又称作“一线通”。另外,ISDN也特指使用这项技术创建保持和断开电路交换的协议组。主要种类ISDN有窄带和宽带两种。窄带ISDN有基本速率(2B+D,144kbps)和一次群速率(30B+D,2Mbps)两种接口。基本速率接口包括两个能独立工作的B信道(64kbps)和一个D信道(16kbps),其中B信道一般用来传输话音、数据和图像,D信道用来传输信令或分组信息。B代表承载,D代表控制。
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中国式英语搞笑

世界上最强的中国式英文 1.we two who and who?咱俩谁跟谁阿 2.how are you how old are you?怎么是你,怎么老是你? 3.you don"t bird me,I don"t bird you 你不鸟我,我也不鸟你 4.you have seed I will give you some color to see see,brothers ! together up !你有种,我要给你点颜色瞧瞧,兄弟们,一起上! 5.hello everybody!if you have something to say,then say!if you have nothing to say,go home!有事起奏,无事退朝 6.you me you me 彼此彼此 7.You Give Me Stop!你给我站住! 8.know is know noknow is noknow 知之为知之,不知为不知... 9.WATCH SISTER 表妹 10.dragon born dragon,chicken born chicken,mouse"son can make hole! 龙生龙,凤生凤,老鼠的儿子会打洞! 11.American Chinese not enough 美中不足 12.one car come one car go ,two car pengpeng,people die 车祸现场描述 13.heart flower angry open 心花怒放 14.go past no mistake past 走过路过,不要错过 15.小明:I am sorry!老外:I am sorry too! 小明:I am sorry three!老外:What are you sorry for? 小明:I am sorry five! 16.If you want money,I have no; if you want life,I have one! 要钱没有,要命一条 17.I call Li old big.toyear 25.我叫李老大,今年25. 18.you have two down son.你有两下 PS:这种中国式英语仅供娱乐,用来学习万万不可,希望可以帮到你,!
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